番茄常见地下害虫有蛴螬、蝼蛄等，菜农应注意做好防治措施。
蛴螬的幼虫终生栖居土中，喜食刚刚播下的种子及幼苗等，造成缺苗断垄。蛴螬的防治方法为秋末深翻菜地，可以将成虫、幼虫翻到地表，使其冻死、风干或者被天敌捕食、机械杀伤。施用充分腐熟的有机肥，用塑料薄膜覆盖、堆闷，高温杀死肥料中的害虫。避免施用未腐熟的有机肥，在施肥前筛捡出有机肥中的蛴螬，以免招引成虫产卵和将幼虫带入菜田。在成虫盛发期，利用金龟子的趋光性，进行人工捕捉或用黑光诱杀。
蝼蛄以成虫和若虫在土中咬食刚播下的种子和幼芽，或者将幼苗根、茎部咬断，使幼苗枯死，受害的根部呈乱麻状。蝼蛄在地下活动，将表土串成许多隧道，使幼苗根部透风和土壤分离，造成幼苗因失水干枯致死，缺苗垄断，致使番茄大幅减产。防治蝼蛄可用毒饵诱杀，将豆饼或麦麸5公斤炒香，再用90%晶体敌百虫150克加水将毒饵拌潮，每亩用毒饵l.5-2.5公斤，撒在地里或苗床上，诱杀蝼蛄。或每亩用50%辛硫磷1-1.5公斤，掺干细土15-30公斤充分拌匀，撒于菜田中或开沟施入土壤中。
