当归用种子育苗移栽繁殖。在海拔较低地区(1500～1800米)也有秋季直播第二年收，或春季直播当年收获的，但产量和质量较低。
育苗地选阴凉湿润的阴山或二阴山，保水但不积水的坑洼地、小盆地，而不选干燥的过风梁。土质要求疏松肥沃，没有石块的大黑土或黑油沙，一般都选生荒地育苗。在平整好的地块上作1米宽的高畦，6月中下旬趁湿将种子均匀地撒在畦面上，覆土埋严，脚踩一遍，再用铁耙搂平。为了保墒，在畦面上盖约3.3厘米厚的柴草。苗出齐以后，过密的地方要间苗。寒露前后将苗挖出，贮藏在阴凉干燥的地方。第二年春天解冻后，整地穴栽。移栽在清明至谷雨期间进行。移栽时随耕随耙平，随即开穴栽苗。一般穴深16.5厘米，行距23～33厘米，穴距20～23厘米，成三角形挖穴。每穴栽苗3株，覆土1.65～3.3厘米。移栽后的幼苗。一般要锄3～4遍。如发现抽薹的植株，随即拔除，同时结合追施油质肥料。
当归易发生根腐病，可用50％退菌特1000倍液喷洒；发生褐斑病后，立即剪除病叶，再喷65％的代森锌500倍液防治。
