枸杞树一般自定植后4―5年为幼树期。此时树体生长旺盛，发枝能力强，若枝条摘心，一年内能萌发三、四次枝。幼树的整形修剪以整形为主，选留强壮枝条培养树冠骨架，逐步扩大树冠，培养枝组，增加结果枝。在树形的选择培养上，要根据栽培条件，灵活采用，以有利丰产为原则，为以后的高产奠定基础。枸杞树形虽有多种，但整形修剪的原则基本相同，只不过各树形的主枝数量和层次等不同。现以圆锥形为例，将幼树的整形修剪方法介绍如下。
第一年定干，定干高度随苗木大小不同而异，粗壮苗一般定干高60厘米，细弱苗定干低些。定干太低了，发出的结果枝搭在地上，花果受损坏，耕作不便。若定干太高，重心不稳，树冠易倾斜，会影响枝条分布、树冠面积及产量。一般在栽植当年离地面高50一60厘米处剪顶定干。定干的当年在剪口下10一15厘米范围内发出的新枝中(若主干上原有侧枝也可以利用)，选4-5个在主干周围分布均匀的强壮枝作第一层主枝，于10-20厘米处短截，使它发分枝。同时还可在主干上部选留3-4个小枝不短截，成为临时结果枝，有利于边整形边结果。对主干上多余枝应剪去。等主枝发出分枝后，在其两侧各选1―2个分枝作一级大侧枝，并于10厘米处摘心或短截(若分枝长势弱，则当年不短截，此任务可在下年进行)。
第二年春，若上年各主发的分枝在当年没短截，则第二年应在各主枝两侧各选1―2个分枝留10厘米左右进行短截，使其发分枝，培养成结果枝，开花结果。同时对第一年在主干上留的临时结果枝若太弱或过密，可以疏除。第二年因树势增强，会从第一年选留的主枝背部发出较直立的徒长枝，可各选一个作主枝的延长枝，并于l0一20厘米处摘心。当延长枝发出分枝后，同样在其两侧各选l一2枝于10厘米左右处摘心，使其再发分枝，培养成结果枝组。主干上部若发出直立徒长枝，选一枝高于树冠面10一20厘米处摘心，培养成为中心干，待其发出分枝时选留4―5个分枝作第二层主枝。若此主枝长势强，可在10―20厘米长处摘心(短截)，促其发出分枝组成树冠。若此主枝长势中庸，短截任务可放在下年进行。对于影响主枝生长的枝条，可以采用撑或拉的方法，把各枝均匀排开，以便发枝构成圆满树冠。生长过密的弱枝和交叉枝等应剪除。
第三至第五年仿照第二年的方法，对徒长枝进行摘心利用，逐步扩大、充实树冠。若中心于上端发出直立徒长枝，则选留三枝高于树冠面10―20厘米处摘心(短截)。若中心干上端不发徒长枝时，可在上层主枝或其延长枝上，高树冠中心轴15―20厘米范围内选1―3个直立徒长枝，也在高于树冠面10―20厘米处摘心(短截)，发出侧枝，增高树冠。
经过4―5年整形修剪，一般树高达1.6米左右，冠径1.0米左右，根颈粗5―6厘米，一个4―5层的树冠骨架基本形成。但是，如果肥水不足，栽培管理条件差，树体生长弱，则不能如期发枝或发枝较弱；那么树冠的形成时间就会推迟。若主干上部不能长出直立的徒长枝，就会形成无中心干的树形。
