麝香鼠原活动在水中，栖息于沼泽地及湖泊河流两岸水草茂盛的低洼地带，以及在浅水旁隐蔽。
麝香鼠善于挖洞，又能筑巢，其洞多筑于隐蔽条件较好的地方，洞的结构由洞道、储粮仓、窝室等部分组成。洞道弯曲多支，纵横交错，洞道出入口随着水位的升降而变化。
麝香鼠善于游泳，游泳时尾巴如橹左右摇摆，四肢如船浆来回摆动，潜水能力强，换气时间约3至5分钟。麝鼠大多黎明和傍晚活动，春、秋两季最为活跃，遇到大风、暴雨或不正常的气候，均停止活动或减少活动量。人工养殖主要是在室外建舍圈，主要设施有小水池、运动场、外室、内室外等四大部组成，占地面积约0.6平方米，同时也可充分利用室外内外空房空地、阳台、楼角笼养，可适应多种生活环境。
