土元的敌害有很多，如老鼠、蚂蚁、粉螨、蜘蛛、鸡、鸭、猫等。
老鼠的防治应随时注意，它不仅吃土元，还搬走土元，损失会很大，要用鼠药或养猫，但用药时要严防土元误食。
蚂蚁虽小，但不可小视，它们的群体很大，也会造成大害。平时要注意房舍的密封，一旦有蚂蚁出现可用最新的氯丹油驱赶，或用骨头、油条、肉类残渣等诱杀。
粉螨主要是由平时喂食不当产生的，所以喂食时要注意适量，最好不要有剩食，温度高时剩食要及时捡出，动物性饲料要熟喂，也可用喷治蜂螨的蜂螨灵喷洒，有一定的杀灭作用。或用炒菜水沾过的湿报纸、骨头、鱼、油条等放在土表面诱杀，每隔1～2个小时引一次，直到引完为止。因为粉螨在土表面，也可将表面的一层土换掉。
蜘蛛对土元的危害不是很大，但出现蜘蛛时也要随时消灭，不然土元有可能被吊食。
鸡、鸭、猫等动物只要加强房舍密封措施，不让其进入是没有什么危害的。
