一、按不同蜜源分别贮藏 不同蜜源的蜂蜜，其颜色、香味不相同，因此最好分别贮藏，以防蜂蜜混杂而降低品质。
二、保持蜂蜜的洁净 生产的蜂蜜中常有花粉块、蜡片、蜂翅、蜂脚等杂质，可将蜂蜜盛入较大的桶内，在温度较高、干燥的室内静置沉淀，除去杂质后贮藏。
三、避免发酵 蜂蜜内常有酵母菌存在，当温度、湿度适宜时，酵母菌便会生长繁殖，导致蜂蜜变酸，影响品质。水分含量较大的蜂蜜贮藏前应加以处理，其方法是将蜂蜜盛入大口容器内，敞开放在干燥、通风、温度在25℃以上的室内，静置数天，蒸发多余水分，然后贮藏。
四、防止吸水分和异味 即使是成熟的蜂蜜，如不注意也会吸湿发酵，最好用密封性好的瓷器盛装蜂蜜，置于干燥、通风的室内，若容器不能密封，贮藏室内绝不可同时存放有强烈气味的物品，以防蜂蜜吸收异味。
五、防蜂蜜结晶 瓶装的蜂蜜要保持外观透明。防止结晶，可用双层锅加热处理，处理时外层装水，内层装蜂蜜，待蜂蜜温度达到71℃时，保持数分钟后去火，静置1天，撇去蜂蜜表面泡沫，装入消过毒的玻璃瓶中，密封即可。
