巢虫是蜡蛾的幼虫，生活在蜂巢内，在巢脾上穿成隧道，纵横吐丝作茧，蛀食巢脾，库存的巢脾会成箱地被巢虫蛀食而空。蜂王产的卵无法孵化，甚至使蜂群全军灭亡。巢虫发生的季节各地不同，但以春秋两季较为严重。因而养蜂人应特别注意防范。
要堵严蜂箱四壁的缝隙，使蜡蛾无法钻入蜂箱产卵。
保持箱内清洁，随时清除箱底污物。特别是第一次开箱检查蜂群时，要清除箱内死蜂，铲出蜡末，经过过筛，每百箱蜂可收蜜盖蜡1.5～2.0公斤，既清理了蜂箱，又增收了蜂蜡，一举两得，使巢虫无处藏身。
蜡蛾白天匿藏在蜂场附近的阴暗处，晚上潜入巢内产卵。根据这一规律，养蜂员可在晚上用手电筒或矿山灯照明，到蜂场附近和蜂箱四壁巡查，发现蜡蛾立即扑杀。必要时可掀开蜂箱大盖捉拿蜡蛾。消灭一只蜡蛾。相当于消灭若干巢虫。
在被侵害的巢脾中查出隧道后，用镊子将巢虫取出杀死。将巢脾放在凉水中浸泡，也能杀死巢虫。对于那些还没蛀出隧道、生活在粉脾上的小巢虫，可将蜂抖落掉，将巢脾放在阳光下，巢虫一见热，马上暴露，再用镊子取出杀死。
秋季蜂群渐弱时，应将多余的脾提出，放在空继箱里，用二硫化碳或硫磺熏蒸消毒。二硫化碳用量为每3只继箱18～20克，熏蒸前箱与箱之间缝隙用纸糊严，或将继箱和脾装进筒式塑料袋，放入二硫化碳沉降时，即可杀死巢虫。用硫磺熏蒸时，最下边可放一只空继箱（防止起火苗，烤坏巢脾），再叠摞装有空脾的继箱，在空继箱内用碳火点然硫磺，由产生的浓烟熏杀虫卵。巢脾用清水浸泡后，要放在摇蜜机内脱水。
冬季库存的巢脾，特别是带有花粉的脾，可搬到室外冻3～4天。使漏网的巢虫冻死。这样做不但防治巢虫，还能防治白垩病发生。
把粉脾和其它脾分开保管，春繁加脾时，先使用粉脾，切断产生巢虫的后路。
