蚯蚓是一种生命力很强的动物，常年钻在地下吃土，疾病很少，只有几种病，而且这几种病都是人为造成的，都是环境条件或饲料条件不当而造成的“条件病”。这些病只要调整一下环境条件就可以解决，几乎不用药物治疗，现介绍如下。
1、饲料中毒症
发现蚯蚓局部甚至全身急速瘫痪，背部排出黄色或草体液，大面积死亡，这是新加的饲料含有毒素或毒气。这时要迅速减薄料床，将有毒饲料撤去，钩松料床的基料，加入蚯蚓粪吸附毒气，让蚯蚓潜入底部休息，慢慢就可以适应了。
2、蛋白质中毒症
如发现蚯蚓的蚓体有局部枯焦，一端萎缩或一端肿胀而死，未死的蚯蚓拒绝采食，有悚悚颤栗的恐惧之感，并明显出现消瘦。这是由于加料时饲料成分搭配不当引起蛋白质中毒。饲料成分蛋白质的含量不能过高（基料制作时粪料不可超标），因蛋白质饲料在分解时产生的氨气和恶臭气味等有毒气体，会使蚯蚓蛋白质中毒。发现蛋白质中毒症后，要迅速除去不当饲料，加喷清水，钩松料床或加缓冲带，以期解毒。
3、缺氧症
如果发现蚯蚓体色暗褐无光、体弱、活动迟缓，这是氧气不足而造成蚯蚓缺氧症。其原因有如下几点：①、粪料未经完全发酵，产生了超量氨、烷等有害气体；②、环境过干或过湿，使蚯蚓表皮气孔受阻；③、蚓床遮盖过严，空气不通。此时应及时查明原因，加以处理。如将基料撤除，继续发酵，加缓冲带。喷水或排水，使基料土的湿度保持在30―40%左右，中午暖和时开门开窗通风或揭开覆盖物，加装排风扇，这样此症就可得到解决。
4、胃酸超标症
在发现蚯蚓痉挛状结节、环带红肿、身体变粗变短，全身分泌粘液增多，在饲养床上转圈爬行，或钻到床底不吃不动，最后全身变白死亡，有的病蚓死前出现体节断裂现象。这说明蚯蚓饲料中淀粉、碳水化合物或盐分过多，经细菌作用引起酸化，使蚯蚓出现胃酸超标症。处理方法是掀开覆盖物让蚓床通风，喷洒苏打水或石膏粉等碱性药物中和。
5、水肿病
如发现蚯蚓身体水肿膨大、发呆或拼命往外爬，背孔冒出体液，滞食而死，甚至引起蚓茧破裂或使新产的蚓茧两端不能收口而染菌霉烂。这是因为蚓床湿度过大，饲料PH值过高而造成的，这时应减小湿度，把爬到表层的蚯蚓清理到另外的池里。在原基料中加过磷酸钙粉或醋渣、酒精渣中和酸碱度，过一段时间再试投给蚯蚓。
