一、兔舍建筑应选择向阳、干燥的地方，并要保持环境的清洁卫生。
二、食具要勤清洗消毒，兔笼尤其是笼底板要定期用火焰消毒，以杀死卵囊。
三、断奶以后至3月龄的兔应用药物控制球虫病的发生，且不分季节。为防止产生抗药性，可采用几种抗球虫药物轮换使用。常用预防球虫病的药物及用法：抗球星广谱苯乙腈类抗球虫病药，以每百公斤饲料混药100克饲喂。氯羟吡啶以每百公斤饲料混药20～25克饲喂。兔球灵每日每公斤体重50毫克口服或每百公斤饲料50克混饲。氯苯胍每日每公斤体重15毫克拌料。上述药物也可用于治疗，一般用预防剂量的2～3倍，毒性强的药物除外。不完全喂料时应在料中增加用药量。在众多抗球虫病药中，含有马杜霉素的各种剂型的药，不能用于兔，否则会发生中毒死亡。