1、地面消毒:兔舍地面是獭兔小环境的部分，也是獭兔排泄粪便的场所，因此地面消毒很重要。每天应及时清扫粪便;地面可撒一些生石灰，经常保持兔舍通风、干燥、清洁卫生。定期喷洒消毒药物如来苏尔或20%的苛性钠。
2、兔舍消毒:引种前2-3天，应对兔舍彻底消毒，一般采用的方法是熏蒸消毒方法:①高锰酸钾25克，甲醛溶液70-100ml混合，不久发生剧烈反应，挥发到空气中的甲醛气体有强烈的杀菌消毒作用;②有条件的可安置紫外线灯，紫外线有强烈杀菌消毒作用。可持续照射5-6小时，停12小时，反复使用效果更好，薰蒸消毒也反复使用2-3次，引种前12小时停止使用。
3、笼具消毒:
(1)一般消毒(指笼具使用期间的带兔消毒):按使用说明用百毒杀，拜洁或水易净等配成一定的比例，喷洒消毒，一般3天一次。
(2)彻底消毒(指引种前全舍消毒或把兔从笼内提出的不带兔消毒):按使用说明用杀菌力较强的消毒液，如来苏尔，甲醛、烧碱等，但应注意消毒后不能立即放兔，须放置2-3天再放兔。还可用喷灯火焰消毒，火焰应达到笼具的每个部位、火焰消毒数小时后便可放兔。彻底消毒一般1月一次。
4、水、食盒的消毒:一般一周消毒一次，具体方法是将水、食盒从笼具上取下，集中起来用清水清洗干净，放入配制好的消毒液中浸泡30分钟，再清洗待晾干后即可使用。
5、产箱的消毒:使用过的产箱应倒掉里面的垫物，用清水冲洗干净，晾干后，在强日光下爆晒5-6小时，冬天可用紫外线灯照射5一6小时，再用消毒液喷雾消毒备用。
