双孢菇在栽培过程中常出现薄皮菇和空心菇，这对产量和品质有较大影响。如何预防薄皮菇和空心菇呢？
薄皮菇症状为菌盖薄，开伞早，质量差。形成主要原因是因为温度偏高，子实体生长速度快、成熟早，加上蘑菇密度大，营养供应不上所致。产生薄皮菇还与品种的特性有关。贴生型品种，大多数出菇密，容易产生薄皮菇，产量低，质量差。气生型品种，培养料和覆土层过薄，再加上喷水少而轻，造成营养和水分供应不足，会产生薄皮菇。培养料过生、过薄、过干也易出现薄皮菇。覆土后调水期间由于喷水轻，喷水次数多，凋水快，调水后菇房通风少，菇房内空气湿度大，菇的生长部位过高，子实体结在细土表层，根基浅，同样易产生薄皮菇。如在土层调水期间适当通风，使出菇部位在粗土与细土层之间，就可减少薄皮菇发生。
空心菇症状为菇柄切削后有中空或白心现象。主要是由于出菇期间，菇房空气湿度过低，菇体水分蒸发快，再加上土面喷水少，土层过干，迅速生长的子实体得不到水分的补充，就会在菇柄产生白色疏松的髓部，甚至菌柄中空，形成空心菇。如在蘑菇盛产期，及时喷水，并适当进行间歇喷重水，不使土层过干，就能使快速生长的子实体得到充足水分，预防空心菇的产生。
