适于毛木耳袋栽的原料很多，如杂木屑、棉籽壳、破籽棉、蔗渣、桑树枝、木茹秆、稻草、黄豆秆、花生藤等等。除杂木屑、棉籽壳、破籽棉、蔗渣外，其余原料要加工碎粉后方能用于生产。毛木耳袋栽工艺流程与金针菇袋栽工艺流程基本相似，主要不同点是出耳管理，毛木耳可向子实体喷水，而金针菇则不能直接对子实体喷水。现将栽培过程中几个关键技术分述如下：
　　
　　一、把好培养料配制关：培养料是木耳生长的物质基础，无论采用哪种原料，都要求原料要干燥、干净、无霉变、无硬杂物等。根据原料来源难易选择培养料配方。现提供几种配方作参考：①杂木屑55%、棉籽壳27.5%、麦夫15%、石膏粉1.4%、白糖0.8%、碳酸钙0.3%；②杂木屑78%、麦夫18%、石膏粉1.6%、糖1%、过磷酸钙1%、尿素0.4%；③蔗渣80至85%、麦夫13至18%、糖1%、石膏粉1%、另加玉米粉3至5%等等。根据所采用的配方，并事先把主料在烈日下曝晒2至3天，秤取主料、配料，混合均匀，浸湿润透，切勿混杂有干料，否则消毒不彻底而易染杂菌。培养料拌匀后，含水量在60至65%之间为宜，酸碱度（ph值）在6至6.5为宜。
　　
　　二、把好装袋质量关：首先袋的质量至关重要。毛木耳袋栽一般采用17×33至45厘米的聚乙烯筒料，筒料厚度为4丝以上，膜内没有泡点，袋壁无破洞，袋的一头先用棉线扎好。装袋时用装袋机边装边扎好另一头，要求培养料要装得松紧适度、密度一致，这是关键所在。培养料拌好后四小时内要装完袋，并立即进行消毒灭菌，以免料堆发酸变质。
　　
　　三、把好灭菌彻底关：木耳袋栽用熟料栽培，灭菌不彻底是菌袋产生污染的重要原因之一。要达到灭菌彻底，必须做到几个方面：第一、装锅时，蒸笼内排放菌袋要分层排放，要留有排气通道，便于排除冷气；第二、开始烧火时一定要猛火攻，使蒸笼内温度尽快升到100℃，使蒸笼内冷气尽快排除；第三、蒸笼内温度达100℃，不等于料内温度达100℃，所以计算保温时间必须在蒸笼内温度达100℃之后一小时算起，也就是说要求保持100℃8小时，实际要达9小时才有把握。
　　
　　四、把好接种关：接种成功的关键是要有一个无菌的环境和熟练的接种技术。接种室要提前灭菌，除用高锰酸钾+甲醛薰蒸外，还用紫外灯灭菌半小时或用5%石炭酸喷洒，而且菌袋温度降到30℃以下才能接种，接种时要快而准确，一次完成，提高接种的成功率。采用菌袋两头接种要用干净的棉花做棉塞，如果采用菌袋打洞接种，菌种要放满而且紧实，注意防止菌种掉落。
　　
　　五、把好发菌关：发菌好坏与出耳势、抗逆性和木耳产量密切相关。要抓好培养室的消毒，地面、耳床上都要撒生石灰粉，造成碱性环境抑制杂菌发生。此外发菌室要黑暗、通气，温度以20至25℃为宜，不得超过28℃。发菌阶段，每5至7天要全面检查一次，发现杂菌感染的菌袋要及时拿出处理。菌丝长满袋后再培养10至15天，让菌丝充分成熟才能进行出耳管理。
　　
　　六、抓好出耳管理关：在菌袋发菌培养成熟后，可搬到阴棚内按箱宽1.3米，长视地形而定起箱，用竹木制架，像香菇袋栽一样摆放耳筒，菌袋不必脱袋，在袋四周开“√”或“×”形6至8个出耳口即可。排好后用竹片插成拱形，盖上薄膜保温保湿，每天揭膜1至2次，通风换气，并加强喷水管理（尽量不喷对出耳口），使拱内空气相对湿度达85至90%，5至7天出耳口即有耳基形成，继续加强管理10至15天待耳片充分展开，并有少量耳片散落灰白色孢子粉即可采收，采收时必须把耳根采尽，以免杂菌感染或虫害造成烂耳，影响下批耳的生长。每采完一批耳，停止喷水几天，让菌丝恢复生长，又进行出耳管理。采收2至3批耳后，菌袋培养基失水变轻，可向菌袋注水，又可收2至3批耳，或把菌袋薄膜脱掉，把耳筒平摆于槽沟内，盖3至4厘米厚的肥土，加强喷水，保持盖土湿润，10至15天又可长出木耳来，也有一定的收成。