黑木耳栽培技术的不断革新；使单产和产量大幅度的增长，但还满足不了外贸出口和人民日益增长的需要。随着人工栽培技术的推广和发展，进一步推动了代用料栽培木耳新技术的试验研究。目前主要以塑料袋栽培为主，其方法如下：
(1)生产流程
40天左右的栽培种（塑料袋）接种后经2个月左右→栽培袋（塑料袋）开洞→耳芽形成→成熟采收→第二次耳芽7～10天15～20天10天形成→成熟采收→第三次耳芽形成→采收15～20天10天15－20天
(2)选用优良菌种
栽培黑木耳的菌种，是由段木栽培黑木耳菌种中驯化筛选而来的，因此，并不是所有适于段木栽培菌种都可作为代料栽培的菌种。栽培种的菌龄在30～45天为适宜，这样的栽培种生命力强，可以减少培养过程杂菌污染，也能增强栽培时的抗霉菌能力。一般选择菌丝体生长快，粗壮，接种后定植快；生产周期短、产量高、片大、肉厚、颜色深的作为菌种。
(3)栽培季节
在陕西及附近几个省，利用自然温度一年可以栽培两次，春季一月上旬开始制原种，二月上旬制栽培种，三月中旬制栽培袋，四、五、六月出耳。秋季八月中旬制栽培袋，九、十、十一月出耳。
3．栽培方法
(1)配方
许多农林产品下脚料都可用来栽培黑木耳，下面介绍几种培养基配方：
①木屑培养基配方
木屑（阔叶树）78％
麸皮（或米糠）20％
石膏粉1％
白糖1％
水65％左右
②棉籽壳培养基配方
棉籽壳90％
麸皮（或米糠）8％
石膏粉1％
白糖1％
水65％左右
③玉米芯培养基配方
玉米芯（粉碎成黄豆大小的颗粒）70％～80%
锯木屑（阔叶树）10％～20％
麸皮（或米糠）8％
石膏粉1％
白糖1％
水65％左右
④稻草培养基配方
稻草（新鲜稻草粉碎或铡成小段）75％
麸皮（或米糠）15％
锯木屑（阔叶树）8％
石膏粉1％
白糖1％
水65％左右
如果条件许可，在上述培养基中加入百分之二的黄豆粉更好。
(2)调料与装袋
将以上培养料按比例称好，拌匀，把糖溶解在水中注入培养料内，加水翻拌，使培养料含水量达65％左右。或加水至手握培养料，有水纹渗出而不下滴为度，然后将料堆积起来，闷30～60分钟，使料吃透糖水，立即装袋。装袋的方法有三种，各有利弊，可根据情况选择使用。
第一种方法，选用厚度在5微米左右，袋大小约17厘米X33厘米的底部为方形的塑料袋。如购买到平底袋（和食品袋一样），在装袋之前，先将袋底部两个角向内塞至两个角碰到即可，这样装入培养料后平稳，能直接放于培养架上。装袋时，将已拌好的料装入袋内，边装边在平滑处用力振动，使培养料密实，并上下松紧一致，这时培养料的高度约为袋高的3／5，用干纱布擦去袋上部的残留培养料，加上塑料颈套（内径34厘米、高3厘米）把塑料袋口向下翻，用橡皮筋扎紧，形状像玻璃瓶口一样，塞好棉塞。
第二种方法，选用直径13厘米的简状聚丙烯塑料袋，剪截为35厘米的长度，一端用棉线扎紧，再用烛火或酒精灯火焰将薄膜烧熔化，使袋口密封。从开口的一端把培养料装入袋内，边装边在料堆上振动，或用手指压实，待装至距袋口5厘米处为止，然后把余下塑料袋扭结在一起，用棉线扎紧，在烛火或酒精灯火焰下，将薄膜熔化密封。在光滑的桌面上用手将袋压成扁形。再用直径2厘米的打孔器，在袋的一面，每隔10厘米打一直径2厘米、深1.5厘米的洞。用剪刀把准备好的药用胶布，剪成3～4厘米见方的块；贴在洞口上。为了便于接种时操作方便，胶布的其中一角卷成双层。
第三种方法，选用直径13厘米的商状聚丙烯塑料袋，一端用线绳扎着，从另一端把培养料装入袋内、用手把料压实，待料装至距袋口5厘米处为止，然后把余下的塑料袋收拢起来，用线绳扎着、以后接种从两头接。应该注意：无论哪种装袋方法，都必须做到，当天拌料，装袋，当天灭菌。
4．灭菌与接种
装好的栽培袋放在高压灭菌锅里灭菌，在15公斤／厘米2的压力下保持1.5～2小时，待压力表降到零时，将袋子趁热取出，立即放在接种箱或接种室内。若用常压灭菌灶灭菌，保持6～8小时，待袋温下降到30℃时，或用高锰酸钾和甲醛熏蒸30～40分钟，进行接种箱或接种室空间消毒。接种时要注意，连续接种不要时间太长，以免箱内温度过高（超过40℃）；接种量要多些，可以缩短菌丝长满表面的时间，减少杂菌感染的机会。前已述及，黑木耳抵抗霉菌，特别是木霉的能力比较弱，因此，灭菌一定要彻底，接种时一定要按无菌操作进行，提高成品率。
5．菌丝培养
在菌丝培养的全过程中，要创造使菌丝体健壮生长，又能控制黑木耳子实体无规棒形成的条件。在诸条件中，温度是最重要的因素。培养室的最适温度为22℃～25℃，由于袋内培养料温度往往高于室温2℃～3℃，所以培养室的温度不宜超过25℃。待别是在培养后期（即菌丝长到培养料高度约1/2以上），温度超过25℃，在袋内会出现黄水，水色由谈变深，并由稀变粘，这种粘液的产生，容易促使霉菌感染。培养室的相对湿度50％～70％，如果湿度太低培养料水分损失多，培养料干燥，对菌丝生长不利，相对湿度超过70％，棉塞上会长杂菌。光线能诱导菌丝体扭结形成原基。为了控制培养菌丝阶段不形成子实体原基，培养室应保持黑暗或极弱的光照强度。培养室内四周撒一些生石灰，使成碱性环境，减少霉菌繁殖的机会。栽培袋放在培养染或堆积在地面上培养菌丝时，不宜多翻动。因为塑料袋体积不固定，用手捏的地方体积变化，把空气挤出袋处，当手去掉时，其体积复原，就有少量的空气入内。这样就有可能进入杂菌孢子。另外，在手接触袋壁的地方；增加了塑料袋与培养料的压力，遇到较尖锐的培养料（锯木屑、棉籽完）就会刺成肉眼看不见的小孔，杂菌孢子也会由此而进入，增加感染率。因此，在培养过程中尽量少动，在检查杂菌时，一定要轻拿轻放，发现杂菌应及时取出，另放在温度较低的地方；继续观察。若污染程度比较轻，可用甲醛药液注射到杂菌处，并用小块胶布把针眼贴着，可控制杂菌继续蔓延。
6．开洞
当黑木耳菌丝长满提时，即可将菌袋从培养室移到栽培室，把棉塞、塑料颈套去掉，袋口用绳子扎好；或把胶布揭掉；准备两盆5％的石灰水，先将袋子放在一个盆里浸洗干净，取出。用刀片在袋子的四周，按两洞之间5～6厘米的距离开长度l～1.5厘米，深及料内0.3厘米小口，也可先在菌袋的一侧开洞。将已开洞的菌袋在另一盆石灰水中浸泡一下，使洞口处于碱性环境，可有效地防治杂菌危害。
7．出耳期管理
开洞后的菌袋，可平放在栽培室的菌床架上，也可以悬挂在苗床架上或林下树枝上，也可以放在铺湿沙的地面上，随即创造黑木耳形成子实体原基的条件。首先要增加栽培环境的相对湿度达90％～95％，室温尽可能控制在20℃～25℃，良好的通风和较强的散射光照也是黑木耳原基形成必不可少的条件。开洞处菌丝体能得到较充足光线、空气和湿度，有效地促进了此处子实体的形成。所以开洞栽培黑木耳，子实体都在开洞处形成或在塑料袋的破裂处形成。这就是所谓的"定向出耳"。
在适宜的温度、湿度、通风和光照条件下，一股开洞7～12天，肉眼能看到洞口有许多小黑点产生；并逐渐长大，连成一朵耳芽（幼小子实体）。这时需要更多的水分，15℃～25℃的温度，较强的散射光照和良好的通风。如果遇见连阴雨天气，可把已形成耳芽的栽培袋挂在露天下，温、湿、光、空气都能充分满足，耳芽发育更快。这时，如果在耳基部或幼小耳片上发现有绿霉菌和橘红色链孢霉污染，可将菌袋在水龙头下，小心放水冲洗掉杂菌，但且勿把子实体冲掉。在适宜的环境条件下，耳芽形成后大约10～15天，耳片平展，子实体成熟，即可采收。
8．采收与加工
黑木耳成熟的标准是耳片充分展开，开始收边、耳基变细，颜色由黑变褐时，即可采摘。要求勤采，细采，采大留小，不使流耳。成熟的耳子留在菌袋上不采，易遭病虫害或流耳。采收时，用小刀靠袋壁削平。采收下的木耳要及时晒干或烘干。烘烤温度不超过50℃，温度太高，木耳会粘合成块，影响质量，木耳干后，及时包装贮藏，防止霉变或虫蛀。采收后的菌袋，停止直接喷水四五天，让菌丝积累营养，经过10天左右；第二茬耳芽形成，重复上述管理，还可采收两茬。
