一、选择适当的包装材料：选择防潮性、气密性和坚固性良好的包装材料。就目前来说，选择聚乙烯为内包装、厚纸箱为外包装为佳。聚丙烯作包装材料也可以，但不能使用聚氯乙烯，以防止氯离子渗入于香菇。
二、放置干燥剂：在密闭贮存的干香菇容器内，放入生石灰、无水氯化钙或硅胶等干燥剂(经包装处理)，可防止干香菇吸潮发霉，并阻止氧化反应的发生。
三、低温避光贮藏：密封的干香菇应在15℃下避光贮藏，在1℃～5℃下贮藏效果更好，贮藏场所应避免阳光直射。为此，仓库最好建在楼上，屋顶要有遮阴或降温设备。
四、防止虫害：为了降低害虫，在包装时要做好防虫、防杂工作，不能将虫卵和不卫生的杂物装入袋内。干香菇进库前，库房应用磷化铝进行密闭熏蒸消毒，待无药味时再入库。在贮藏过程中若发现害虫，可将干香菇重新放到50℃～55℃环境中烘1～2小时，以杀死害虫。也可用下列方法熏蒸处理：每立方米空间约用二硫化碳100克，熏蒸24小时；用氯化钴17克，熏蒸24小时；用溴甲烷30克，熏蒸24～48小时；用磷化铝1～4片(每片重3克)，熏蒸3～5天。熏蒸时要严格遵守有关规定和要求，以充分发挥药物效果，并避免污染事故发生。
