拟指环虫症
病状：鱼只鳃部受到感染而呼吸困难、嘴巴持续张开。鱼只无精打采、厌食、眼珠浑浊，并且鱼体有三角形的斑点（顶点朝向后面）。
病因：拟指环虫（Pseudodactylogyrus，一种类似指环虫（Dactylogyrus）的吸虫纲寄生虫）。
治疗方法：使用抗寄生虫药剂治疗，但必须注意使用剂量以及是否适用于无脊椎生物。另外，也可考虑让感染鱼只洗个淡水浴，但要特别小心。
指环虫症
病状：鱼只呼吸急促、鳃持续地张开，但并无卵圆鞭毛虫（Oodinium ocellatum）或白点虫（Cryptocaryon irritans）等的外部症状。
病因：由指环虫（Dactylogyrus）或其他种类的吸虫纲寄生虫所引起的。它们可利用钩盘吸附在鱼体上，是大约为1mm的小虫。
治疗方法：使用福尔马林（每4.5公斤/1加仑，加3cc37%的甲醛溶液）浸泡治疗15-30分钟，再用治疗卵圆鞭毛虫（Oodinium ocellatum）和白点虫（Cryptocaryon irritans）的方法进行药物处理。
卵圆鞭毛虫症
病状：在鱼体、鱼鳍上出现微细、灰尘般的斑点，病鱼会在礁石或珊瑚等物体上摩擦患部。鳃组织同时可能出现红肿现象，病鱼的鳃部闭合较快，呼吸也会受到影响。
病因：一种单细胞的寄生虫--卵圆鞭毛虫（Oodinium ocellatum）引起的寄生虫感染，又称为“珊瑚礁鱼病”。感染的情形是寄生虫先在水族箱底形成孢囊，再由孢囊释出新生虫体。
治疗方法：使用抗寄生虫药剂或含铜的药物治疗，有极高的治愈率。细菌感染
病状：鱼体局部或大范围肿胀。如果肿胀开始胀裂，可能会导致二次感染（如果鳞片突起，就要一并参考水肿的处理方法）。
病因：细菌感染。
治疗方法：使用含铜的药物，并用含药物成份的饲料喂食。
斜管虫
病状：鱼体出现不透明部份，尤其在背面最为常见。
病因：斜管虫（Chilodonella，一种单细胞的寄生虫），经常会侵袭伤口或溃疡附近的皮肤，并可能蔓延到鳃上，使鱼窒息。
治疗方法：使用抗寄生虫药剂治疗。此种寄生虫一定要有寄主方能生存，所以可让水族箱空上3-5天，里面的寄生虫就会死亡。
白点病
病状：在鱼体或是鱼鳍上出现2mm左右的白点，病鱼会在礁石或珊瑚等物体上摩擦。如果鳃组织也受到感染，呼吸也会变得急促。
病因：海水白点虫（Cryptocaryon irritans）寄生而引起，这种单细胞寄生虫会侵入外层的皮肤，可能引起二次感染。
治疗方法：使用抗寄生虫药剂或含铜的药物治疗，但必须注意使用剂量以及是否适用于无脊椎生物。
