龟苗进行消毒处理，可以提高龟的成活率，预防疾病的发生。实践证明，即使是健康龟，也多少会带有病源体，如不进行消毒，一旦条件适宜，就会引发疾病，造成损失。
目前，一般养殖户大多采用漂白粉，高锰酸钾、食盐和抗生素等药物消毒。采用此法，必须事先对龟苗进行检查(包括混养的鱼类)，然后根据不同的病源体，分别采用不同的药物进行消毒处理。所以，难度大，要求高，稍有差错就易产生副作用，一般养殖户不易掌握。
浙江省海宁市龙头阁两栖爬行动物研究所经过多年的实践，摸索出采用维生素C溶液对龟苗进行消毒。
此项新方法，对龟苗的皮肤和皮肤膜既有保护作用，又有杀菌效果。因为，当维生素C与龟苗表皮和皮肤膜中的胶原蛋白质结合后有促进胶原组织如结缔组织，皮肤等细胞间质的形成和功能，从而起到保护皮肤的作用。同时，维生素C是一种酸性物质(也叫抗坏血酸)，当酸度达到一定浓度时，就有杀菌消毒作用。所以，采用维生素C对龟苗消毒处理，不但方法简单，而且效果好，成本低，便于广大养殖户掌握应用。
维生素C溶液消毒处理的操作要点是：用一只直径1米的塑料大盆，装8kg水，放入4g维生素C原粉，搅拌使其充分溶解后放入160只龟苗，浸泡10分钟即可消毒杀菌，然后放养，养殖户可根据自己龟苗数量，定量用药，一般一盆药水可用4次800只龟苗。
