根据近几年调查情况，大蒜生长期间发生的病虫害主要有大蒜白腐病、大蒜叶枯病、紫斑病和斑潜蝇、葱须鳞蛾、蓟马。
一、大蒜白腐病
1、发病规律：以小菌核在土壤中和病残体上存活越夏、越冬。借助雨水或灌溉水以及人为进行传播，成为下季或次年的初侵染源。大蒜白腐病始病期从12月中旬开始发病，到次年2月中下旬达到发病高峰期。根据大蒜白腐病发病规律，积极指导农户在发病前（11月底12月初）进行防治，减少损失。
2、大蒜白腐病防治：大蒜白腐病属土传病害，药剂拌种较为有效，药剂拌种是控制种传、土传病害，预防病害流行的常规基础措施，经济高效，可大力推广普及。药剂可选用2%宁南霉素水剂250-300ml拌大蒜种100公斤。或用多菌灵、甲基托布津拌种（用药量：蒜种重量的0.5―1.0%）。
二、大蒜叶枯病和紫斑病
防治。在发病初期，可选用姜葱蒜病清 60g /亩、克疫霜 75g /亩或世高 50g /亩，兑水 50Kg ，或几种药交替使用，每隔7―10天施药一次，连续三次，能有效控制大蒜叶枯病和紫斑病的危害。
三、斑潜蝇、葱须鳞蛾、蓟马防治：首选药剂以阿维菌素类等药剂进行防治。
