一般情况下，彩椒棵与棵之间的枝叶相互重叠之前不进行整枝，尽量增加第一茬果的产量。当第一茬果实采摘完毕后，营养生长会加快，此时开始整枝，根据长势和空间每棵留2至3个主枝，长势强的留3个主枝，长势弱的留2个主枝，周围有缺棵的植株或空间较大的地方可以选留4个主枝。需打顶的分枝一般留3至4片叶后拿顶，留果一般从主枝上留；如果主枝未坐住果实，也可以在分枝上留一个果实后打顶。打顶时展开的叶子要保留，将未展开的叶片和多余的花蕾打掉。
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