1、环境特殊，常见的病害典型症状不明显。温室大棚和露地条件不同，由于环境条件特殊，使得一些主要病害的典型症状在温室大棚里的表现发生变化。
如黄瓜霜霉病在温室里的病斑就要比露地条件下大，因为不易克服的高温环境，常为多种病的发生提供条件。因此，这种条件下病原菌可以侵染到叶脉上。在低温下，黄瓜炭疽病在叶片上也失去了边缘比较明显的近圆形、黄褐色病斑这一典型症状，而变成了边界不清的灰白色褪绿浸润状污斑。有关温室大棚条件下不同病害的症状表现，有时因为棚内温湿度的原因造成诊断上的误差，给各种病害的防治带来一定的难度。
2、条件适宜，多种侵染病害混合发生。温室大棚常可见到在温室大棚里多种病害同时发生，特别是一些症状比较接近的病害混合发生，无疑要给识别带来困难。
例如在低温寡照时期，日光温室里黄瓜可能在多种细菌性病害发生的同时，也会混有霜霉病、炭疽病、疫病和灰霉病等侵染病害的发生，而有些病害的症状非常接近，例如出现在植株叶片上的病斑，有可能是霜霉病和细菌性角斑病同时发生而造成的，因为这两种病害发生的时机和发生条件差不多，在特定的情况下，很难识别并及时预防。
3、非侵染病害发生的频繁，常会给人造成误判。温室大棚中，常因光照、温度、水分、空气、土壤和营养、用药以及栽培管理的不当引起植株生育异常的生理病害，特别是在低温寡照阶段，生理病害又常常比侵染性病害发生的普遍和频繁。生理性病害还经常与侵染性病害交混发生，如植株叶片发黄，就有可能是很多原因，有可能是病害，也有可能是缺素症，还有可能是因为地温低而造成的根系发育不良造成的，让人很难在短时间内做出正确判断。
4、新的病害不断地出现，诊断时缺乏经验和有效资料。在温室大棚中，过去较少引起人们注意的一些次要病害，可能由于品种、环境和栽培技术的改变而迅速发展成为主导病害，而且新的病害也在不断地出现。经常有菜农反应，现在大棚中的病害在增多，还很难治愈。往往看着是这种病害，但是在用药以后就是没有效果；这就是因为品种的差异或者是一些菌种变异，由次要病害上升为主要病害。如近期发生较多的褐斑病，以前的时候都只知道是小黄点，不知道是什么病害，该怎么防治。以为是细菌性病害，结果耽误了最佳防治时机，造成病害蔓延。
5、人为因素。在生产过程中，不注意细节，经常随意加大各种农药的喷施浓度，使植株的正常生长受到影响。例如，在前段时间，由于温度较低，导致黄瓜龙头不伸展，一些菜农却不问原因，屡次喷施刺激生长的激素，如赤霉素等药剂，结果造成叶片皱缩，甚至表现出早衰症状。
