嫁接育苗一般选择在日光温室的中部，面积大小依据育苗的多少而定，温室内温度、湿度要有保证，嫁接和嫁接后要短时间遮荫，有条件的最好采用无土穴盘育苗，架床应离地面50厘米。
穴盘应准备两种规格的，一种是50穴的，播种砧木用，一种是72穴的，播种接穗用。基质以草碳和蛭石为好，二者按2:1加入适量的营养液混匀，装盘压实，留下0.5厘米厚覆盖蛭石，同时准备好嫁接夹和刀片。
嫁接方法不同播种时间也不同。插接，要先播南瓜籽，砧木苗要大些，过3～4天再播黄瓜。采用靠接法，两种苗的大小应该一致，应先播黄瓜，5天后再播南瓜。浸种催芽的种子每穴一粒，干籽每穴2粒。播后盖蛭石，浇足水，盖地膜。以后注意补充水分，保持基质湿润状态。
靠接法：接穗苗长到第一片真叶展开、砧木子叶完全展开，此时嫁接最为适宜。嫁接前插好拱棚，地面洇水，覆盖遮阳。嫁接第一步，拿起砧木苗，挖掉生长点，与子叶成直角的一面0.5～1厘米处向下斜切呈30～40度角，把胚轴切到2/3处，接穗在子叶下1～1.2厘米处向上切成20～30度0.7～1厘米的斜口，深入到胚轴的3/5处。第二步，将两个鞋扣互相插入，一定要对正，用嫁接夹夹好立即放入事先准备好的拱棚中。
嫁接后遮荫、保温、保湿，拱棚内空气湿度在95%左右，一般7天后可以逐渐撤掉覆盖物，温度掌握在夜间18℃左右、白天25℃～28℃左右，叶面喷杜邦克露600倍液，防病害，一般情况下18～22天即可定植。