番茄病原性病害主要有：病毒病、枯萎病、灰霉病、叶霉病、早晚疫病、青枯病等。虫害主要有：蚜虫、白粉虱、棉铃虫、烟青虫、根结线虫等。生理性病害：低温冻害、高温障碍、肥害、药害、缺素症、干旱及水涝等。要在栽培管理中提前加强病虫害的前期预防工作，消灭产生病虫害的条件。例如：病毒病发作的主要传媒是蚜虫、白粉虱及接触性传染；大部分真菌及细菌病害都易在高温、弱光条件下发生；因此有效地降低棚室空气温度，增加光照，给予适宜温度，减少各类传播传媒，培育健壮植株，再结合化学药剂防治，就能达到理想的效果，为丰收打下良好基础。
