番茄生产过程中，枯萎病、青枯病和生理性缺水等均会引起植株萎蔫，其中：
因生理性缺水而造成的番茄茎秆中空和萎蔫的现象多发生在寒冬低温季节，这主要是由根系生长不良引起。番茄根系生长最适土温为20～22℃，9～10℃时根毛停止生长，土温降至5℃时，根系吸收水分、养分的能力受阻。寒冬低温季节，植株根系生长受抑，吸收水分、养分的能力也受阻，遇到晴天特别是早晨当太阳出来，棚内温度迅速升高，而根系却难以迅速吸水，从而造成植株萎焉。这种生理性缺水造成的番茄茎秆中空和萎蔫一般在年后随着气温的升高，根系生长恢复正常后症状会减轻。
因枯萎病和青枯病引起的植株萎蔫则不同，往往会给番茄生产带来极大危害，造成减产，甚至绝收。二者的主要区别在于：①病菌不同：番茄青枯病是一种细菌性病害，番茄枯萎病是一种真菌性病害。②发病生育期不同：番茄青枯病一般在番茄株高30cm左右(成株期)开始发病，而番茄枯萎病则一般是在番茄开化结果期开始发病。③萎蔫现象不同：番茄青枯病的病株白天萎蔫，傍晚恢复；番茄枯萎病白天萎蔫，傍晚不会恢复。④病程不同：番茄青枯病病程进展迅速，严重的病株经7～8天即死亡；番茄枯萎病病程进展缓慢，病株一般要经15～30天才枯死。⑤番茄青枯病植株枯死，叶片不变色，仍保持绿色，而番茄枯萎病枯死后，叶色变黄。⑥ 横切番茄青枯病病茎，用手挤压或经保湿，切面上维管束会溢出白色菌液；横切番茄枯萎病病茎，切面上维管束不会溢出白色菌液。⑦病菌越冬形式不同：番茄枯萎病病菌以菌丝体或厚垣孢子随病残体在土壤中或附着在种子上越冬；番茄青枯病病原细菌主要是随病残体留在田间或在马铃薯块上越冬。
预防番茄茎秆中空和萎蔫的措施主要有：
①冬春季节栽培番茄时，应注意保护和促进植株根系的生长。可采取的措施包括：加强保温；不要偏施氮肥，应适当施用一些氨基酸或富含微量元素的叶面肥料；也可施用一些促进根系生长的其他制剂；阴雨天气过后或阳光强烈时，覆盖物应逐渐去除，以免出现生理性缺水对植株造成伤害。
②加强病害监测，早防早治。青枯病可用6%春雷霉素可湿性粉剂300～400倍液；72%农用链霉素可湿性粉剂500倍液；72.2%霜霉威水剂（普力克）800～1000倍液；30%DT可湿性粉剂600倍液等浇根防治。枯萎病可用2.5%咯菌腈（适乐时）悬浮剂1000倍液；20%噻菌铜悬浮剂（龙克菌）400～500倍液；77%硫酸铜可湿性粉剂（可杀得）1000倍液；50%硫菌灵可湿性粉剂（托布津）800～1000倍液等浇根。