温度管理：秋冬茬番茄定植前期，外界气温较高，昼夜温差小，扣棚膜后，要进行全天通风，降低温度防止番茄幼苗徒长。当外界最低气温降到12℃，夜间关闭通风口。当外界最低气温降至8℃以下时，夜间覆盖草苫，避免发生冷害。
定植及定植后的管理：番茄根系生长的最适宜的土温（5厘米~10厘米）为20℃~22℃，地温高于30℃，会阻碍根系的正常生长，由于秋冬茬番茄定植时间在9月，此时地温较高，故此秋冬茬番茄在定植时，可先不覆盖地膜，待番茄正常生长后再覆膜，防止覆膜后地温过高引起植株死棵。定植时浇定植水，同时喷施新高脂膜，保墒保肥，缩短缓苗期。定植后5天~7天浇缓苗水，之后蹲苗并要进行2次~3次深中耕，松土保墒，提高土壤通透性，促进番茄根系深扎。
花果期管理：分别在开花前、幼果期、果实膨大期喷施菜果壮蒂灵，提高花粉质量，增强循环坐果率，预防落花、落果，提高茄子品质。茄子长到核桃大小时施追肥、灌水，每亩施尿素10公斤。同时注意磷钾肥配合施用。
病害防治：秋冬茬番茄9~11月，病害重点防治早疫病、叶霉病和灰霉病。进入12月后，病害重点防治灰霉病和晚疫病。防治病害首要的是降低棚室内湿度，加强通风排湿，促使棚内空气流通。及时整枝打杈，摘除下部老、病叶，通风透光，改善田间小气候环境，定期喷施新高脂膜，使植株健壮生长，提高植株抗病抗逆能力。