拱棚越夏西红柿果部病害较多，常发病害主要是以下三种：
脐腐病 主要危害幼果。发病初期，在果实脐部出现水浸状暗绿色病斑，逐渐变成暗褐色或黑色，严重时扩展到半个果实。后期果实上有黑色霉状物。土壤忽干忽湿，缺钙，氮肥施用过多，植株徒长，均可促使发病。
防治方法：合理施用肥水。在坐果期喷施1%过磷酸钙或1%氯化钙溶液，每两周一次，连喷两次。
日灼病 天气干旱，土壤缺水，处在转色期前后的果实，受强烈日光照射，致使果面灼伤。患病果实向阳面有光泽，似透明的革质状，后变黄褐色斑块。有的皱缩变硬，果肉变成褐色块状。
防治方法：增施有机肥料，提高土壤保水能力。摘心时，在顶层花序上面留2～3片叶，以利覆盖果实，减少日灼。强光照时应覆盖遮阳网。
裂果 生长期遇高温、烈日、干旱和暴雨以及土壤水分变化剧烈都可出现裂果。裂果主要有环状裂果和放射状裂果，裂口易受病菌侵入，引起腐烂。
防治方法：加强栽培管理，保持土壤湿润，防止过干过湿。适当密植，合理整枝，使果穗隐蔽在枝叶之间，防止阳光直射果实。果实出现裂口时要及时喷洒农用链霉素防止烂果。