番茄猝倒病常发生在幼苗出土后、真叶尚未展开前，病菌侵染后幼苗茎基部发生水渍状暗色斑，继而绕茎扩展，逐渐缢缩呈细线状，使幼苗地上部失去支撑能力倒伏。苗床湿度大时，在病苗及其附近床面上常密生白色菌丝。苗床低温高湿，幼苗生长缓慢时易发病。
防治方法：（1）采用快速育苗或无土育苗法，做好苗床、穴盘和棚室消毒。加强苗床管理，看苗适时适量通风，避免低温高湿条件出现，不在阴雨天浇水。（2）苗期喷施0.1％～0.2％磷酸二氢钾溶液或0.05％～0.1％氯化钙溶液，提高植株抗病能力。（3）苗床消毒，每平方米苗床用40％五氯硝基苯粉剂9～10克，拌细土4～4.5公斤。播前浇一次透水，水渗下后取三分之一药土撒在畦面上，播种后覆盖余下的药土。也可以在发病前或发病初期用普力克72.2％霜霉威盐酸盐水剂400倍液喷淋，每平方米用药液2～3公斤。（4）及时用药防治。可用克露72％霜脲·锰锌可湿性粉剂600倍液，或69%锰锌·烯酰水分散粒剂1000倍液，或58%甲霜·锰锌可湿性粉剂500倍液，或75％百菌清可湿性粉剂600倍液喷雾，隔7～10天一次，视病情防治1～2次。