1、选用抗、耐病品种
番茄黄化曲叶病毒病目前仅在局部发生, 但由于该病毒主要通过烟粉虱传播, 鉴于烟粉虱强的生存与扩展能力, 要将该病毒病限制在一个地点和阻止其传播和扩散有很大的难度, 同时该病毒病危害重, 又几乎无药可治, 因此抗病毒病育种成为消除番茄黄化曲叶病毒病威胁的主要策略。目前国内对番茄黄化曲叶病毒病的品种抗( 耐) 性选育研究还甚少，导致很多种植户与农户由于得不到抗病的优良品种，只能少种植，甚至改种其他蔬菜品种。为此，国内一些科研院、所和种子生产企业及农业技术推广部门加强与国内外企业、院校合作和交流，在抗病品种培育和推广上开展了大量工作，目前优良品种的筛选工作正在进行，以TY病毒重灾区山东省为例，区域内寿光、临淄、广饶、莘县等蔬菜主产区纷纷成为国内外种子企业、院校试验TY的前沿基地。以“蔬菜之乡”--寿光为例，数十家国外知名种子公司，如：瑞士先正达、以色列海泽拉、荷兰瑞克斯旺、荷兰德澳特等陆续推出了抗TY病毒的番茄品种。
2、加强栽培管理
培育无虫、无病壮苗。育苗床与大田生产要分开；苗床应选用近年来未种过茄科、葫芦科、十字花科等蔬菜的田块，育苗基质及苗床土壤要进行消毒处理，减少虫源与病源；育苗棚用40-60目防虫网隔离育苗，避免苗期感染；每亩苗床悬挂45cm ×25cm黄色粘虫胶板10-15块，诱杀烟粉虱，减少传毒媒介。
生产上要适当控制氮素，增施磷钾肥，适当喷施微量元素等叶面肥，保持田间湿润，肥水管理少量多次，促进植株健壮生长，提高植株的抗病能力。同时要及时检查，发现病株应立即拔除，减少病源传播；此外还应该及时清除田间杂草和残枝落叶，以减少虫源。
3、化学防治
至今还尚未发现防治番茄黄化曲叶病毒病的抗病毒制剂。据报道，番茄黄化曲叶病毒病一旦大面积发生，选用20%毒克星、2%菌克毒克、50%消菌灵和高锰酸钾等的防治效果均不明显，但可以在没有发病或发病前期，喷洒2%菌克毒克700-1000倍液，7-10天喷洒一次进行预防。此外，生产上为了减少该病的发生，要加强对温室烟粉虱的防治，可选用25%阿克泰4 000 倍液、1.8%阿维菌素3 000 倍液或36%啶虫脒水分散粒剂，4-6克/亩等进行喷雾。
4、轮作换茬，确保增产增收。
轮作换茬不仅有利于防止病虫害的发生和连续危害，还有利于夺取蔬菜高产稳产，换茬如上肥，由于不同种类蔬菜对于营养要求各不相同，轮作换茬可有利于不同作物在同一块土地对营养的选择性吸收，从而使作物增产。对于西红柿病害严重的地方可换种西葫芦、青椒等作物。