番茄不同生育阶段的栽培管理重点不同，要区别对待。
移栽活棵期：培育壮苗
番茄移栽后小水勤浇，大水漫灌对番茄根系伤害大，易造成毛细根（白根）减少、黄叶等现象。此期最好在膜下浇小水，减少浇水对根系的伤害。一般在番茄定植后5天浇缓苗水，之后10～15天浇促根水。番茄生育期长，需肥量大，仅靠基肥难以满足开花结果的需要，应根据植株长势施肥。从苗期到结果前期，对茎秆细、叶片发黄、长势差的田块施肥，促根、壮苗。番茄喜肥但不耐肥，施肥应掌握少量多次的原则。
开花结果期：护花保果促转色
合理点花 2,4-滴使用浓度一般为10～20毫克／公斤、防落素使用浓度一般为20～40毫克／公斤，高温时使用低浓度，低温时使用高浓度。使用前先进行点花试验，即先点几朵正常的花，若4～5天后子房开始膨大，表明浓度适宜；若3天以内子房开始膨大，表明浓度过高；若1周内未见子房膨大，表明浓度过低。在花顶见黄但未完全开放或花朵呈喇叭状时点花，选晴天下午进行。早晨点花时植株表面有结露，会使药液浓度发生变化，产生药害。点花方法：用毛笔将配好的药液轻涂在花柄或花梗上，药液不能滴到幼叶或生长点上。
合理留果 根据品种特性留果，留果不能过多。番茄留果数量根据植株长势而定。
促转色 果实转色期棚温调控不科学、管理方法不当，很容易导致着色不均匀。番茄着色的好坏取决于果实内茄红素的含量。实践证明，气温在19～24℃时易形成番茄红素，促进果实转色。结果期疏除过多的叶片有利于果实着色，但要保留适量的叶片进行光合作用。转色期及时疏除病叶和植株下部的老叶、黄叶，以及果实周围遮光的叶片，其他叶片尽量不疏除。此外，要适时施钾肥，钾肥应作基肥或在结果初期施用，果实变红后施钾肥效果不明显。
生长后期：及时防病防裂果
预防病害 番茄生长后期抗病能力降低，易发生晚疫病、早疫病、灰霉病、叶霉病、细菌性斑疹病、溃疡病、叶枯病及生理性病害等，应提前预防、综合防治。
防止裂果 裂果是果肉生长速度大于果皮生长速度时出现的果实开裂现象。生产上常见的有番茄环裂和纵裂2种。环裂即围绕果背出现一圈一圈细小的横向裂口，纵裂即围绕整个果面出现细小的纵向裂口。造成番茄裂果的主要原因是品种特性、放风不适宜、肥水供应不均衡、摘果过晚等，喷药浓度偏高也易发生裂果。