近年来在番茄生产中，各地都有脐腐病的发生。此症的表现是在茄果膨大期，由于果实脐部向下，见不到太阳的部分颜色变褐，有的干枯，有的腐烂，对产量和品质影响很大。在施肥上应该注意以下几点：
1.重视苗床施肥做到“胎里富”，最好施用有机肥加化肥。化肥的施用要控氮增施磷肥的比例，尤其磷肥品种以选用普钙或钙镁磷肥为优。
2.基肥深施，有机肥与无机肥结合，在不施有机肥的情况下，化肥品种不一定选择高浓度复合肥，更不一定选择高塔造粒高氮复合肥，而要选择单质氮肥加普钙磷肥，钾肥用硫酸钾或氯化钾都可。酸性土地区的磷肥选择“钙镁磷肥”为佳。
3.追肥主要施用氮钾肥，注意肥水结合，追肥次数分第一果膨大期的催果肥；第二、三穗果膨大期的壮果肥。追施3~4次。
4.进入盛果期后，根系衰弱吸肥能力下降，可以采用根外喷肥的方法，喷施磷酸二氢钾、硝酸钙、硼砂和尿素等成分的水溶液，有利于后期壮株壮果，减少脐腐病的发生。