植物病毒对寄主的危害，素有“植物癌症”之称，防治上十分困难。病毒在侵染寄主后，不仅与寄主争夺生长所必需的营养成分，而且破坏植物的养分输导，改变寄主植物的某些代谢平衡，使植物的光合作用受到抑制，致使植物生长困难，产生畸形、黄化等症状，严重的造成寄主植物死亡。
番茄病毒病是番茄的重要病害，南北分布都较普遍。全国各地都有发生，常见的有花叶病、条斑病和蕨叶病三种，以花叶病发生最为普遍。近几年来，有些地区条斑病的为害日趋严重，植株发病后几乎没有产量，对番茄影响极大。蕨叶病的发病率一般低于花叶病而高于条纹病，但其为害则大于花叶病。
番茄病毒病是由多种病毒侵染所致。主要病毒有烟草花叶病毒(TMV)和黄 瓜花叶病毒(CMV)。病毒病的发生和气候条件关系密切，高温干旱易于发生和流行。番茄前期病毒病较轻，主要由病残体和种子内携带的烟草花叶病毒引起，经移植定植等农事操作传播。
进入5月份后，气温达20℃时，蕨叶和花叶病开始加重，这与此时黄瓜花叶病毒增加有关。棚室周围多年生杂草是CMV 的越冬宿主，蚜虫是CMV 的主要传毒介体。凡棚室周围杂草多，棚室内蚜虫较重，病毒病也可加重。
番茄病毒病的防治要以预防为主，治疗为辅，综合治理。一方面在种植上加强管理，措施如下：①选用抗病品种。②加强栽培管理，合理轮作，收获后清除病残株，注意田间操作中手和工具的消毒。③种子消毒，用清水浸种4小时后捞出放入10% 的磷酸三钠液中浸20分钟后洗净催芽播种。另一方面发病后及时进行药剂防治：①施用病毒钝化剂：如菌毒A ；②切断传播途径：吡虫啉或毒死蜱；③补充作物养份，加速生长：叶面喷施芸苔素内脂如硕丰481，云大120等。同时应避免棚内温度过高，在持续三天以上高温时应采取有较的降温措施，如加盖遮阳网、在棚顶喷洒泥浆水或秸秆沫等，有防虫网应特别注意控制棚内温度。
高温时间长会导致各地病毒病发生严重，主要是西红柿的簇顶病毒，很多苗期定植时就感染了病毒，气温的快速升高，会引起大面积发病，发病率高的达到90% 以上，常见的病毒钝化剂(如盐酸吗啉胍等)效果不明显，无法控制，影响了治疗效果，由沈阳农业大学植物病毒研究所吴元华教授研发的新型抗病毒生物制剂—菌毒A(成分嘧肽霉素-胞嘧啶核苷肽)，新型生物农药，成分新，无抗药性，防治效果好，一到两遍就能控制住，四到五遍就可有效治疗病毒病。