番茄植株生长到一定高度时，如不支架和绑蔓，就容易倒伏，这不仅妨碍田间管理，而且不利于通风透光，影响光合作用，需进行支架或吊绳使其直立生长。保护地内宜采用吊绳缠蔓，能够减少遮荫，而且作业方便迅速，绳的一端固定在保护地骨架上，绳的另一端绑短竹竿插入土中，绳要拉紧，避免植株倾斜，随着植株的生长，及时将茎蔓缠绕在绳上。番茄的整枝方法较多，冬春茬番茄产量高，效益好，主要是因为留果穗多，采收时间长。生产中多采用以下方法整枝：
(1)连续换头整枝 头三穗果采用单干整枝，其余侧枝全部打掉，以免影响通风透光。第一穗果开始采收时，植株中上部选留1个健壮侧枝作结果枝，采用单于整枝再留3穗果。当第4穗开始采收时，再按上述方法留枝作结果枝，上留3穗果摘心，其余侧枝留1片叶摘心。果实采收后，叶片全部打掉，以利通风透光。
(2)多穗单干整枝法 每株留8-9穗果，2-3穗成熟后，上部8-9穗已开花，即可摘心。摘心时花序上留2片叶，打杈去老叶，减少养分消耗。留果多，有机肥施用量大，生长期间植株喷布两次矮壮素。