一是作物在生长发育过程中，都会分泌出一定的物质(包括某种气体)，而黄瓜和西红柿的分泌物有互相抑制生长发育的作用，二者如果同棚相邻栽培，其生长势都将受到影响。
二是黄瓜和西红柿都易发生和遭受蚜虫的危害，一旦一方发生蚜虫，就会很快地蔓延到另一方，增加有效控制的难度。
此外，黄瓜和西红柿在生长发育过程中所需的温度不同，因此在管理上很难做到兼顾二者，往往顾此失彼，影响经济效益。
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