冷藏主要是将菠菜维持在冰点附近的低温下而不使菠菜有明显冻结。其做法与冻藏大同小异。只是贮藏沟稍宽稍深，覆土也较厚，仅覆士厚度和分期覆上时间应根据当地气候条件灵活掌握，不然会使菠菜受热腐烂。
冷藏的菠菜一般在立冬至小雪间起菜，随即下窖或短期贮藏几天，下客后菜上可盖一层甘蓝叶，沟顶盖秫秸或草苫。以后随天气转冷加盖草苫或纸被，使沟内温度稳定在0～2℃。入贮后要注意检查，必要时可倒动1～2次。 上述贮藏方法可以更好地保持菠菜的生机和耐贮性，降低贮藏损耗。
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