近年来，温室韭菜疫病有蔓延趋势。该病菌属弱寄生苗，主要靠流水传播为害。发病初期，叶尖出现一些针尖大小黄圆点，最后病斑连成片，严重时使叶子枯黄干死，影响韭菜的新产量和品质。其主要防治措施是：
小水勤浇。疫病靠水流传播，如大水漫灌，很容易造成室内湿度过大，使该病流行蔓延。此外，追肥时要注意追施磷钾肥，氮肥偏多会造成疫病扩展。
拾净枯叶。当残病叶片干枯落在地上时，要拾净，并及时通风，以减少室内病菌来源。
浇水后及时通风。室内温度过大，容易发生疫病。所以每次浇水后，要及时通风，以降低室内温度。放风要选在晴天中午进行，通风时间2～3小时为宜，棚室面积以40～50平方米为宜，面积不宜过大。
喷药防治。室内发现韭菜病叶，要及时进行药剂防治，可用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液或40%乙磷铝可湿性粉剂400倍液喷雾防治，每隔7～10天喷一次药，连续喷3次，即可收到良好效果。喷药时不可浓度过大，以免造成药害。