干枯病是唐菖蒲重要病害。又称“镰刀菌腐烂病”，“球茎干腐病”，“枯萎病”。病菌主要为害球茎。在球茎萌发，生长期和贮藏、运输过程中均有发生。初期球茎鳞片基部及其两侧出现水浸状斑点，呈红褐或褐色，稍凹陷，病斑扩展为圆形或不规则形甚至整个球茎，使之变成黑褐色干腐。在潮湿天气，腐烂部位表面长白色丝状物。带病球茎种植于田间，重则不能抽芽，或长出纤弱苗，很快死亡。轻病球茎虽可出芽长成正常植株，但最后顶叶变黄，逐渐回枯，直至植株枯死。田间成株期间发病时，外边的叶片尖端开始黄化，然后延及内侧叶片也变黄，植株生长停滞，此时地下球茎已腐烂，直到整株枯死。花部症状在有色品种的花瓣比正常的颜色变深、变窄、边缘略卷，少花、变小，向上倾斜，不能充分开放。
唐菖蒲干枯病是由半知菌亚门、丝孢纲、丝孢目、瘤座孢科、镰刀菌属的唐菖蒲尖孢镰刀菌侵染引起的。病菌主要以镰刀形的分生孢子侵染传播。温度在5-35摄氏度范围均能生长发育，但以27.5摄氏度最活跃。
唐菖蒲干腐病菌存在于病球茎和土壤中，从伤口侵入，水的流动，人的园艺操作均可传播病害。栽种带病球茎、病土连作、氮肥过多，雨天收获球茎，伤口不易愈合等因素都会增加感染，使病情加重。
防治方法
1、晴天挖掘球茎，采用热风循环通过装球茎的筐子，在30摄氏度条件下吹干，球茎开始干燥时，翻动1-2次。干燥后贮藏于5摄氏度以下，干燥、通风的室内。对可疑球茎，选取放入清水中浸12小时，捞出后浸入含5%酒精的水温为53.3摄氏度30分钟，风干后贮藏。
2、大田生产，可采用2-3年轮作，温室栽培和盆栽，应用无病土或进行土壤消毒。
3、种植前将球茎用50%多菌灵500倍液浸泡30分钟，再用福美拌种后种植。
