种子繁殖法在百合的种植中很少采用，因为这种方法从种到开花一般需好几年时间。但在某些特定场合和条件下仍需要采用。如台湾百合和王百合从种子种下到开花只需一年半时间，所以也经常使用。另外在新品种培育过程中也经常采用种子繁殖法。在实施时应做好以下几方面的工作：
（1）播种基质的选择： ①二份土壤，二份腐叶土(或发酵锯末)加一份河沙。 ②珍珠岩和蛭石混合一份，二份土壤二份腐叶土。
（2）要注意种子发芽的特性： ①慢发型种子需要经过两个冬天后才出苗，如鹿子、天香等百合品种。 ②快发型需要经过一个冬天后即可出苗，如王百合、台湾、山丹等。
（3）播种深度0.5厘米以下（播后撒上层薄复合土即可）。
（4）将慢发型种进行适当处理，可提前出苗，缩短开花年限，方法如下： ①温暖处湿藏三个月(装入湿润的珍珠岩、蛭石、泥碳土中并装入塑料袋保湿)。 ②等到幼苗上有小鳞茎和幼根时再在冰箱中放置2―3个月或更长时间。 (5)适时移栽大田(第二年3―4月移栽)。 (6)加强田间管理。
