切花菊在运输距离较近或者运输较少的情况下，通常不需要包装就可以直接送到花卉市场，但是长距离运输，特别是跨国间切花出口，必须进行包装。
切花菊在运输距离较近或者运输较少的情况下，通常不需要包装就可以直接送到花卉市场，但是长距离运输，特别是跨国间切花出口，必须进行包装。切花菊的包装遵从切花包装的一般原则：
①保护产品免受机械伤害，尽力保证其完整无损或无擦伤。
②允许热交换，不可完全封闭式包装。
③及时排除田间热，设法降低呼吸强度。
④包装箱要有足够强度，能经得起正常搬运和码堆。
⑤包装箱上印有商标、说明或使用方法。
常用的包装材料有纤维板箱、木箱、加固胶合板箱、纸箱、塑料袋等。在过去多用木制品进行包装。因为塑料制品重量轻、可以重复利用，近年来，各式各样的塑料包装被广泛应用。目前我国主要应用的为纸箱，纸箱的尺寸一般长110厘米，宽35厘米，高15厘米。这样的纸箱可以装100枝花，每10枝捆成1束，底层放5束，隔一个U形纸板，反方向再放5束，然后封闭纸箱。这样有利于纸箱内通气。包装箱的尺寸标准化很重要，规格统一可以方便机械化装卸和运输，装载整齐稳定，减少操作费用。每5束用薄纸将花朵包起来，防止花瓣直接接触箱壁摩擦受伤。目前在运输过程中还是以人工搬运为主，如果重量超过30千克，搬运过程中容易受伤，同时要考虑到方便计算，所以独头切花菊最好采用每箱100枝、最多不超过200枝的规格。一般在长距离运输（时间超过1天）时，要考虑到切花呼吸放热，最好利用冷藏车或者冷藏集装箱。
现在，国外先进国家已经使用自动筛选机和捆扎机协助包装：去掉下位叶、按要求长度切好、根据重量分类，然后进行捆扎，每小时可以处理1500～1700枝切花。我国目前大多仍然采用人工来完成。
