苹果树腐烂病与轮纹烂果病是苹果树健康生长的大敌。因此，加强对其的预防和除治是提高挂果期苹果树单位面积产量、增加果园经济效益的重要途径。
苹果树腐烂病苹果树腐烂病俗称“烂皮病”，是苹果树最重要的枝干病害，也是造成苹果树树势衰弱、死枝死树甚至毁园的最直接原因。苹果树腐烂病是由腐烂病菌侵染所致的病害，腐烂病菌是一种弱寄生菌，具有潜伏侵染的特性。防治上采取以下措施可显著减少该病的为害。
一是增强树势，科学预防冻害，减少树体伤口，减少营养消耗提高树体抗病能力是根治苹果树腐烂病的首要措施也是基本措施。
二是加强肥水管理，适度疏花、疏果，合理负载产量，严禁过度环剥，剪口、锯口最好用“绿云”愈合剂涂抹，加快伤口愈合，避免发病，扶强健壮树势是防治苹果树腐烂病的有效措施。
三是刮除病斑，于2月下旬-5月下旬、8月下旬-9月上旬及时将腐烂病斑刮成梭形，彻底刮除病斑坏死组织，周围刮去健皮0.5～1cm深达木质部，刮成立茬、平整(促进愈合)，刮后用“果康宝”5倍液或“腐迪”原液等涂抹病疤，铲除菌源是防止侵染、预防复发、减轻发病的重要措施。同时，刮刀也要常用药液消毒，以免带毒传病。
四是早春结合修剪、锯除重大病枝、剪除细弱病残枝、刮除腐烂病斑、于发芽前全树喷果康宝200～300倍液或园易清300倍液、膜力丹1000倍液；在腐烂病严重的果园，用果康宝20倍或园易清30倍涂干(从地面到1.5m处的主干)或者全面细致喷洒7.5%强力轮纹净50-100倍液铲除园内腐烂病菌，生长期刮除复发或新增病疤、涂抹7.5%强力轮纹净5-10倍液于新老病疤交接处预防复发，控制发病。
五是对于较小病斑可直接在病斑上敷厚3～4cm的胶泥(超出病斑边缘5～6cm)，用力贴紧裹紧塑料带，防止雨水冲刷和早裂；严重病斑可使用硫酸羟基喹啉和植物生长激素，并加入液体塑料涂敷，封闭病斑，让病菌缺氧酶中毒死亡。树干基部病害严重时，可采用泥土堆埋的方法根治病害。
六是在5～8月果树愈伤能力强的时期，将主干、主枝基部树皮表层刮1～2mm，达到“病灶刮尽，新皮露白、幼皮露青，刮面光滑”的要求。刮后不涂药，当年就可长出新皮。
七是及时处理病残枝、烧毁刮下烂病皮，禁用苹果树枝做篱笆也是防治苹果树腐烂病不应忽视的环节。
八是成年树病斑过大的，在春夏季进行脚接和桥接，以恢复树势。
苹果轮纹烂果病苹果轮纹烂果病又称轮纹褐腐病或粗皮病，是近些年来红富士苹果最重要的果实和枝干病害。苹果轮纹烂果病是由苹果轮纹病菌和干腐病菌单独侵染或复合侵染所致的潜伏侵染性病害。是一种既可侵害枝干，又能为害果实的特殊病害。
苹果轮纹烂果病菌，一部分去侵染果实，造成果实发病，另一部分则去侵染枝干，造成枝干发病，但不论是果实发病，还是枝干发病，当年的新病斑都不能产生新的病菌孢子，不能形成再侵染。因此苹果轮纹烂果病是一种枝干病瘤越冬，幼果期皮孔侵染，近成熟期开始发病的潜伏侵染性病害，具有雨频高湿利于侵染，秋季高温利于发病的特点，据此确定的防治策略是“早刮病瘤除病源，幼果套袋防侵染，秋季喷药防扩展，低温贮藏防腐烂”。具体防治方法如下：
一、晚秋、早春结合刮治腐烂病，刮除枝干病瘤和病斑，清除园内腐烂落果，集中销毁，减少侵染来源。并喷膜力丹1000～1200倍液或用“膜力56”5～10倍液在刮除病斑老翘皮后涂抹。3月下旬至4月初喷3度石硫合剂。对发病重的大中枝干全面涂抹一遍7.5%强力轮纹净悬浮剂5-10倍液，压低树上菌源。
二、苹果树发芽前，全园喷布一遍7.5%强力轮纹净悬浮剂50-100倍液，铲除树体和围栏植物体上的越冬菌源。果实套袋前2～3天，喷罗克1000倍液或凯歌4000倍液(多菌灵、绿色甲托也可)。摘袋后可再喷1次“强力轮纹净”。实施苹果套袋栽培技术，这是目前物理防治轮纹烂果病、提高苹果色泽、降低果品残毒的唯一有效方法。
三、果实侵染期，轮换交替连续用药保护果实，免遭侵染，这是降低果实带菌率，减少后期发病的重要方法。苹果套袋前连续防治3次，用药间隔期10天，可轮换选用70%甲基托布津可湿性粉剂800倍，68.75%杜邦易保水分散性粒剂1500倍，80%大生M-45可湿性粉剂800倍，50%扑海因可湿性粉剂1200倍，20%扑菌灵悬浮剂600倍。苹果套袋后连续防治5-6次，用药间隔期10-15天，可选择以甲基硫菌灵、多菌灵、代森锰锌、乙磷铝等为主要成分的复配农药与1：2―3：200的波尔多液轮换交替施用。
四、果实发病期，应用内吸性杀菌剂控制病菌扩展，减缓果实发病，这是轮纹烂果病防治的补救措施。苹果摘袋前选用40%福星乳油8000倍液或70%甲基托布津可湿性粉剂800倍喷雾可控制病害发展，降低发病率。
五、8月，用膜力丹50倍液涂刷粗皮病部，促进健皮生长。
六、贮藏期严格剔除病果，注意控制温、湿度。
