腐烂病在发病现象上有春、秋两次高峰，尤以春季为甚，秋季视年份（主要是降水的多少）而有小高峰。防治腐烂病的根本环节是抓好侵染期的防治，生产中主要侵染期在秋季。由于春季防治的不彻底性――老病斑的复发、病原苗的新侵染是造成秋季的侵染上升或主要的致病环节，这与目前生产者连年只重视春季防治而忽视秋季防治有着直接关系。
秋季果实采收前后由于气侯条件适宜（主要是温度），遇秋雨连绵或雨雾天气，孢子大量分生、消散、萌发，加上此时树体营养大都转化到果实中去，树体抗力处于较弱阶段，采收期不可避免的伤口以及药剂防治的忽视，便造成大量病菌侵染。因此，秋季应加强苹果树腐烂病的防治。
