1.防腐处理
菠萝采后贮藏通常须先作防腐处理，常用的方法有以下几种。
①用复方多糖保鲜剂喷涂菠萝果实，晾干后，装筐堆放在室温下，能有效地控制黑腐病，对黑心病也有一定的防治效果。贮存20～30天，完好率可高达85%以上，且以留冠芽的果实效果更好。
②将果柄在用联苯酚2.7kg加水378.5kg配成的药液中浸一下，在通气较好的箱中贮运，或用聚乙烯包装，相对湿度90%，可贮藏15天以上。冷藏的适宜条件为：温度8～10℃，相对湿度90%～95%。
③用250mg/L萘乙酸和250mg/L2.4-D配成的溶液喷洒菠萝果实，对黑心病有一定的抑制作用。
④将适时采收的菠萝经预冷散热后，用1%二苯胺或用2.55%丙酸钠或用1%山梨酸水溶液浸过的包裹纸包裹，放在果筐内置于适宜的贮藏条件下（温度7～10℃，相对湿度85%～90%）。这样贮藏1个多月尚可食用。
2.贮藏方法
①冷藏。低温可以抑制菠萝的转黄、衰老，并可抑制黑腐病的发生，减少腐烂，延长贮藏寿命。但应注意防止低温冷害，菠萝采用7～10℃温度，90%左右相对湿度，可贮藏保鲜20～30天。采用7℃温度，7%的氧气进行气调冷藏，可延缓后熟转黄，减少蒂端的表面腐烂，改善外观，提高销售货架寿命。用20%石蜡聚乙烯与水混合涂果顶，可延长贮期，防止冷害发生，或减轻冷害。菠萝运至销售地一般可短贮10～15天。
②气调贮藏。适合菠萝的气调贮藏方法通常用薄膜塑料袋包装或用石蜡涂封。主要是利用菠萝自身呼吸作用形成低氧、高二氧化碳气调环境，以减少失重，推迟果实转黄，减缓成熟衰老过程。此法贮藏1个月左右尚能保持果皮新鲜、果蒂青绿、果实饱满、肉质不变，具有良好的色、香、味。
具体方法有二：其一是在菠萝果皮色泽全青时采收，采收后用0.1%的2.4-D钠盐或0.2%重亚硫酸钠水溶液浸果，晾干后选好果装入预先放在箱（筐）内的薄膜袋中，袋底及袋内四周垫草纸。果实放满后，面上再覆盖一层草纸，然后密封袋口。其二是待菠萝7～8成熟时无伤采收，经预冷散热后浸入已溶化且凉至有凝结的蜡液中，待菠萝上层小果没入蜡液后随即取出，使果面均匀地封上一层薄蜡。将经以上任意一种方法处理的菠萝，置于温度7～10℃、相对湿度85%～90%的室内或库内贮藏。
