脐橙幼树根系分布少而浅，易受旱害。尤其是在高温少雨、风大的气候条件下，更应注重水肥的管理工作。树盘内土壤要经常保持湿润状态，避免土壤干燥开裂而损伤根系，影响幼树根系的正常生长；追肥应掌握勤施薄施的原则，可采用0.3%～0.5%的尿素兑水浇施，株施50克尿素为宜，施肥过重易产生肥害。在新梢萌发前和新梢停止生长后各施一次，以促进新梢的正常生长和充实健壮。8月下旬以后不宜施速效氮肥，以免促发晚秋梢，削弱树势。10月下旬至12月上旬，每株用25公斤农家肥和0.5公斤普钙混合施用，挖30厘米以上施肥沟进行沟施，并结合灌水。1～2年生幼树均可按照此方法进行水肥管理。
夏梢留7～8片叶摘心，及时浇施速效氮肥，促进新梢转色和充实健壮，促发二次梢。及时抹除树干30厘米以下萌芽，减少树体养分消耗。
脐橙幼树主要病虫有蚜虫、红蜘蛛、潜叶蛾、疮痂病、溃疡病等，其主要防治方法是：
蚜虫 选用50%春冬清园宝800倍液，18%绿园1500～2000倍液，2.5%功夫4000～6000倍液，24%万灵1000～2000倍液防治。
红蜘蛛 选用5%尼索朗2000～4000倍液，73%克螨特2000～3000倍液，50%春冬清园宝800倍液，0.15%螨绝代2000～3000倍液，20%新科乳油3000倍液等农药交替使用防治，连防2～3次，每隔7天一次。
潜叶蛾 主要危害夏、秋梢，应在夏、秋梢萌发一叶初展时及时用药防治。选用2.5%功夫4000～6000倍液，25%杀农双200～500倍液，24%万灵1000～2000倍液，50%春冬清园宝800倍液，18%绿园1500～2000倍液等农药防治，连防3次，每隔7天一次。
疮痂病、溃疡病 选用50%果桃桔大丰收2000～2500倍液，20%除通1200～1500倍液，20%菌铜悬浮剂800倍液等农药，在新梢长度1.5～3厘米时、新梢转绿期各防一次。
