根据实践经验，辨别和鉴定真假杂交水稻种子，一般从以下五个方面去辨别和鉴定。 一是看柱头痕迹（柱头夹持率）：杂交水稻种子属异花授粉，绝大多数杂交水稻不育系在开花受粉时均有柱头外露的特性，取杂交水稻种子若干粒认真观察，在谷壳内外夹缝中间一侧或两侧，可见一点不很明显的小黑点，即柱头痕迹；而常规水稻种子几乎看不到柱头痕迹。 二是看谷壳吻合处：杂交水稻种子谷壳吻合处差，有的种粒留有裂口，而非杂交稻种子，其吻合处好，无裂口并严密结合。 三是看谷粒形状：杂交水稻种子，子粒不整齐，有大小、粗细、长短不一的感觉。而常规水稻种子则整齐一致。 四是看谷尖：杂交水稻种子谷粒色泽黄亮且谷尖多紫色，而非杂交水稻种子的谷尖无色。 五是看谷粒腹部：杂交水稻种子的腹部可见凹状，似成“V”字形。而常规水稻种子的腹部呈直线状。
