大田杂交水稻杂交一代种子常见的杂株有异品种，变异株，不育系，保持系，恢复系，大青棵，小青棵等几大类型，这是由于制种过程中的生物学混杂和机械混杂所致。根据大面积调查表明，混杂株以异品种，不育系，保持系，大青棵、小青棵为主，现将分期除杂具体操作技术介绍如下：
小青棵：籼型杂交，在扬花期易识别剔除。表现属分蘖弱株，具有叶色淡，叶片披长，叶鞘薄淡等明显特点。大青棵：属籼粳交，在分蘖末期至孕穗初期表现叶色浓绿，叶片窄而挺直，剑叶较长，株型较高，分蘖特别旺盛。不育系、保持系：大田分蘖属弱株，而播始历期一般约６０天左右，在秧田后期（特别是二段秧寄插后期）它们表现为株矮，分蘖弱，幼穗分化早，叶片淡黄等性状，在秧田后期或移栽大田时应拔除。恢复系：分蘖弱，叶片较窄，淡绿，易在苗期识别。异品种：在幼苗四叶期，按其假茎宽窄，叶片宽窄长短，叶色深浅，叶片挺拔程度，分蘖强弱，角度大小进行鉴别。变异株；最佳分辨时间在幼穗分化五至六期，根据株型，剑叶长度等性状进行除杂。
做好大田除杂工作有三个要点：一是熟悉所种组合及相应亲本的特征特性；二是要多比较，凡是与杂交种在株型，叶型，分蘖上有微小差异的都要作为杂株除掉；三要分期除杂。
具体操作上可按如下步骤进行：
二段育秧的，幼苗四叶期与寄插第二段移栽前除弱株；大田分蘖盛期除优势株。直播直插育秧的，秧田期移栽前除弱株；大田分蘖盛期除优势株，弱株。大田生产除杂后，要采取适当分蔸剥蘖办法调整田间密度，加强水肥管理，搭起丰产苗架，促进大田增丰收。
