晚季前期高温多湿，后期低温干燥，杂交水稻若施肥不当，则发病严重，空秕粒增加造成减产。为夺取晚季杂交水稻高产，其施肥技术如下：
晚季杂交水稻前期靠分蘖够苗，后期靠大穗粒重才能达到高产，所以施肥应采取“前后重，中间控”的原则，达到插后“30日乌，40日淡绿，50日同青”的禾苗长相。乌是指叶色深绿，这是叶绿素含量高，叶、蘖迅速生长的表现；淡绿是茎叶纤维组织发达的表现；青是茎叶增重的表现。
“前期重”是指前期(插后到幼穗分化前)的追肥及基肥量占全季总施肥量的70～80%。一是施足基肥。基肥一般每亩施入畜粪25～30担，碳铵30～35公斤，过磷酸钙20～25公斤，氯化钾10～12.5公斤。二是及时追肥。第一次追肥在插后7～8天禾苗开始回青时进行，一般每亩施尿素5～7.5公斤。第二次追肥在插后15天左右进行，一般每亩施入畜粪25～30担。这两次追肥的目的，是争取在这段时间每亩最高亩数达20万左右，其中有效穗数每亩达到18～20万。
“中间控”是指中期(从幼穗分化开始至幼穗发育第五期)一般不追肥，只对生长较差的二、三类禾酌情补施一些肥。中期控水制肥，露田晒田，有利于禾苗稳生稳长，使插后40天叶片转为淡绿色，以达到根群发达深扎，茎秆粗壮，叶短厚直。
“后期重”是指后期要施壮尾肥(又叫穗肥或攻胎肥)。施肥的时间和数量主要看禾苗长势而定。禾苗不转淡绿，可少施或不施肥。剑叶抽出一半时，禾苗早衰的要重施攻胎肥，以促进新根发展，延长最后三片功能叶的寿命，使禾苗青枝蜡秆，提高结实率。一般每亩施尿素4～5公斤，过磷酸钙10～15公斤，氯化钾5～7.5公斤。在大胎期(幼穗发育第八期)和灌浆期喷施叶面肥，一般每亩用磷酸二氢钾0.1公斤或尿素，过磷酸钙、氯化钾各0.5公斤，冲水75公斤喷雾。隔5～7天喷1次，连续2～3次。
