1.防浸种时间不足，影响催芽整齐度 稻种吸足一定水分后，体积膨胀，细胞改变原来的休眠状态，开始伸长和分化。浸种时间的长短，要根据水温的高低而定。当水温10℃时需90小时才吸足水，需浸种三四天；当水温达到30℃时需40小时，浸种一二天即可。浸种时吸水不够，种谷出芽就不齐，但也不能浸种时间过长。催芽时仍需保持稻种足水状态（以种皮湿润，谷堆不见明水为宜）。如种子缺水，根长芽短；水分过多则芽长根短，达不到根芽同长的壮芽要求。
2.防种子露白前过多翻动 发芽所需最适温度为30℃～32℃，最高温度为40℃。低于最低温度时萌芽缓慢，甚至停止，时间过长会引起烂种；高于最高温度时则发芽受阻，且有“烧芽”的危险，所以催芽时要严格掌握温度。如果种子露白前过多翻动导致谷堆里热气散失，达不到催芽所需的适宜温度要求，不利于出芽。一般是破胸前温度宜高，破胸后应立即降温，保持30℃～32℃适温。因此，浸种结束上堆后10多个小时不宜翻动，让其保温催稻种露白。
3.防淋水过多 淋水过多，会造成谷堆里缺少氧气，不能满足芽谷的呼吸需要，产生酒味，谷壳外面发黏，造成出芽不快、不齐和不壮。要保持谷堆内湿度适当，一般谷堆表面的谷壳不发白，就不需淋水，始终保持种谷既潮湿而又轻爽的状态，达到湿度与供氧两者协调的要求。
4.防露白后不及时检查 露白后要勤检查，根据温度情况及时翻堆和适当淋水。最好在稻种中插1支温度计，定时查看种子温度，以防出现40℃以上的高温而发生“烧芽”现象。
5.防芽谷不锻炼 稻种催好芽后，如果播热谷下田，容易“伤风感冒”，影响成秧率和壮苗率。因此，齐芽后，应摊薄炼芽一二天，使谷芽逐渐适应环境的转换。