水稻品种鉴别通常采用田间鉴定与室内鉴别相结合，以田间调查为主。
(一)田间调查田间鉴定的主要内容为纯度、熟期和主要特征特性。
生产上推广应用的水稻品种(组合)的固有特征特性，在田间应表现整齐一致的特征特性，根据上述特征特性，可识别不同的水稻品种并且鉴别品种纯度。品种纯度一般用调查植株总数(或室内考种种籽总数)中具有本品种固有特征特性的植株数(或室内考种籽粒数)多少来表示。田间调查可采用在一块田中随机在田中心及四周(不包括边行)五点取样调查。田间调查除根据品种特征特性调查纯度外，还可根据熟期调查纯度，生产上应用的品种(组合)在特定地区都有相对稳定的生育期，不同年份之间品种(组合)生育期有一定变化，但变化不大，即在正常播插期内，特定地区秋前成熟早稻品种不会变为秋季成熟的中稻品种或秋后成熟的晚稻品种。
(二)室内鉴定室内鉴定包括种子鉴别法和理化检测方法以及米质鉴别法。种子鉴别法可根据不同品种种子谷粒长短厚度、稃尖颜色、芒的有无或长短、千粒重、稃毛多少等差异鉴别不同品种，如粳稻品种颖毛长而密，难脱粒，谷米短宽且厚，横断面近圆形；籼稻品种颖毛短而稀，散生颖面，易脱粒，谷米略扁平。
