杂交玉米制种质量的好坏，直接影响种子的质量，对经济效益会产生较大的影响。
一、制种环境
1.杂交制种必须有相应的隔离区，制种时应考虑不同品种之间的隔离区距离。
2.部分农户制种水平和意识不高，不具备时间观念，对制种质量产生严重影响。为提高农户的制种水平，培养其紧迫意识，技术人员需耐心给农户传授制种技术，逐年提高各项制种技术。
二、制种技术
1.确保隔离区
杂交制种要求有一定的隔离区，一般制种玉米隔离距离为300米。
2.种子去杂
播种前去除种子中的秕籽、超大粒、特小粒等粒型不一致和颜色不一致的种子，以初步保证亲本种子的纯度。
3.苗期去杂
整个玉米苗期要进行认真去杂，将芽鞘颜色不一致、叶色、叶型不一致、长势太强和太弱的幼苗拔除，确保保留的幼苗符合亲本一致性的要求。
4.授粉期去杂
①父本去杂 父本去杂是散粉前最关键的环节，必须逐株去除与标准父本特征特性不一致的父本植株，长势太强太弱的要去除，植株太高太大的要去除，叶片颜色不同的要去除，花药的颜色不一样的要去除。此项工作必须在父本散粉前完成，有效地保证花粉质量，保证杂交种质量。
②母本去杂去雄 母本首先要去除雄花，为保证干净，可采取提前2～3片叶摸苞去雄的办法。即母本雄花尚未露出顶叶时，就连顶叶和穗一起拔除。去杂是将母本中的异株拔除，同苗期授粉前相同。
5.砍除父本
当95%以上母本授完粉后，砍除父本，以保证种子不被混杂，提高母本产量。
6.收获
种子收获时应单收、单运、单晒、单脱、单存，防止机械及人为混杂。
7.穗选
收获时将母本果穗中穗轴颜色不一致、粒色、粒型、穗型不一致的果穗全部选出，把病穗、霉穗全部选出，保证生产出高质量玉米杂交种。
三、制种信誉
我区具制种玉米得天独厚的好环境，内地制种单位纷纷涌入新疆，应抓住这一时机，保证种子质量打出新疆制种基地的品牌。
