在玉米粗缩病的防治上，要坚持以农业防治为主、化学防治为辅的综合防治方针，其核心是控制毒源、减少虫源、避开危害。
加强监测和预报 在病害常发地区有重点地定点、定期调查小麦、田间杂草和玉米的粗缩病病株率和严重度，同时调查灰飞虱发生密度和带毒率。在秋末和晚春及玉米播种前，根据灰飞虱越冬基数和带毒率、小麦和杂草的病株率，结合玉米种植模式，对玉米粗缩病发生趋势做出及时准确的预测预报，指导防治。
选用抗病品种 尽管目前玉米生产中应用的主栽品种中缺少抗病性强的良种，但品种间感病程度仍存在一定差异。因此，要根据本地条件，选用抗性相对较好的品种，同时要注意合理布局，避免单一抗源品种的大面积种植。
70年代，豫农704对该病有一定的抗性，目前推广的品种尚未发现高抗病品种，比较抗(耐)病的品种有鲁单50、鲁单053等，在生产上可替代沈单7、掖单53、掖单22等感病品种。在那些已种植感病品种多年，危害严重的地区，种植这几种抗(耐)病品种显得特别重要。在曲阜市，玉米杂交种鲁单50、鲁原单14等对粗缩病的抗性较好。
调整播期 根据玉米粗缩病的发生规律，在病害重发地区，应调整播期，使玉米对病害最为敏感的生育时期避开灰飞虱成虫盛发期，降低发病率。春播玉米应适当提早播种，一般在4月下旬5月上旬，麦田套种玉米适当推迟，一般在麦收前5天，尽量缩短小麦、玉米共生期，做到适当晚播。曲阜市玉米种植模式主要有麦套玉米、抢茬玉米和晚播玉米3种，其中以麦套玉米发病最重，其次为抢茬玉米，再次为晚播玉米。春播玉米应当提前到4月中旬以前播种；夏播玉米则应集中在5月底到6月上旬为宜。
清除杂草 路边、田间杂草不仅是来年农田杂草的种源基地，而且是玉米粗缩病传毒介体灰飞虱的越冬越夏寄主。对麦田残存的杂草，可先人工锄草后再喷药，除草效果可达95%左右。选择土壤处理的优点是苗期玉米不与杂草共生，降低灰飞虱的活动空间，不利于灰飞虱的传毒。
加强田间管理 结合定苗，拔除田间病株，集中深埋或烧毁，减少粗缩病侵染源。合理施肥、浇水，加强田间管理，促进玉米生长，缩短感病期，减少传毒机会，并增强玉米抗耐病能力。
