高赖氨酸玉米具有穗形大，籽粒灌浆期较普通，玉米短，粒重偏轻，抗倒伏能力等特点，高产栽培的施肥应根据这些特点培育壮苗，控制基部1―3节间伸长，促进大穗形成，提高粒重。
高赖氨酸玉米前期施肥要以磷钾肥为主。增施有机肥，每667m2施腐熟倒细农家肥2000―4000kg，结合整地施入最佳。适量施用氮肥。
一、施磷肥原则
当土壤有效磷（P2O5）含量小于10mg/kg克时，每667m2施五氧化二磷5―10kg；当土壤有效磷含量在10―25mg/kg时，每667m2施五氧化二磷2―5kg。
二、施钾肥原则
当土壤有效钾（K2O）含量小于70mg/kg时，每667m2施氧化钾8―10kg；当土壤有效钾含量在70―100mg/kg，每667m2施氧化钾5―8kg。
三、施其他肥原则
增施有机肥可以保证玉米早发稳长，防止早衰并提高化肥利用率。氮肥的施用既要保苗早发，又要防止倒伏。基肥（种肥）每667m2施纯氮6―8kg，对缺锌地块可以每667m2施用硫酸锌1kg。
四、追肥原则
追肥应掌握好速效氮肥的调节和平衡。主功大穗防止早衰，提高粒重的原则，定苗后及时追偏肥，小苗弱苗多施，大苗壮苗少施或不施，促进平衡生长，每667m2追施尿素3―5kg；在大喇叭口期每667m2追施尿素9―11kg；主攻大穗，促进穗大粒多；吐丝期适当补施粒肥，每667m2施尿素3―5kg，防止早衰，提高粒重及产量和品质，有条件的农户可在玉米拔节期喷施叶面肥。
