小麦病害的种类很多，近年来白粉病、纹枯病、全蚀病等发病严重，这些病害的发生给小麦生产带来巨大损失，应及早防治。小麦白粉病可浸染小麦植株地上部分器官，但以叶片和叶鞘为主。初发病时，叶面出现1～2毫米的白色霉点，后逐渐扩大为近圆形或椭圆形白色霉斑，霉斑表面有一层白粉，白粉遇有外力或振动立即飞散。小麦纹枯病主要是禾谷丝核菌和立枯丝核菌浸染所致，病菌以菌核或菌丝体在土壤中或附着在病株残体上越夏和越冬，成为初浸染的主要菌源。小麦发病后近地表的叶鞘上产生淡黄色小斑点，随后发展成黄褐色梭形或眼点状病斑，病部逐渐扩大，最后病株基部茎节腐烂。小麦发病后，植株根部变黑，分蘖减少，成穗率降低，千粒重下降或全株枯死。发病愈早，减产幅度愈大。小麦全蚀病是一种根部病害，只浸染麦根和茎基部1～2节。苗期病株矮小，下部黄叶多，地中茎变成灰黑色，严重时造成麦苗枯死。小麦播种过早时小麦全蚀病发病易重。
对小麦病害的防治，应以农业栽培措施为基础，抗病品种对减轻病害发生有明显作用。如果播期没有抓好种子处理，导致病害发生，要及时采取防治措施。重病田要辅以药剂喷施防治。在发病期进行全面普查，将病株拔出，带到田外销毁。白粉病发病时可用15%粉锈宁可湿性粉剂1000倍液，或50%甲基托布津可湿剂800～1000倍液，或四霉素800倍液均匀喷雾。纹枯病发病初期用5%井冈霉素水剂7.5克对水100公斤，赤霉病可用50%多菌灵或70%甲基托布津可湿性粉剂800～1200倍液，或四霉素600～800倍液喷雾。防治小麦全蚀病等根部病害可在发病初期用四霉素600倍液喷施，注意重点喷施茎基部，同时可兼治小麦白粉病、锈病、纹枯病等病害。