在油菜生长过程中出现的主要病虫害有：蚜虫、菜青虫、病毒病、菌核病、霜霉病；草害有：看麦娘、婆婆纳、猪殃殃、大巢菜等。对这些病虫草害的防治可分两个阶段进行，并根据不同阶段其发生的轻重程度合理用药，就可以把危害控制在允许范围内。
一、苗期
油菜苗期以根、茎、叶等营养器官生长为主，这一阶段主要防治草害、蚜虫、菜青虫和病毒病。
1、草害 水田以看麦娘为主，每亩用10.8%高效盖草能30毫升或5%精禾草克50毫升对水60千克喷雾，于禾本科杂草三至五叶期施用；旱田以猪殃殃、大巢菜、婆婆纳为主，在杂草二至四叶期，每亩用50%高特克40毫升对水60千克喷雾。
2、蚜虫 气温偏高，干旱少雨，油菜长势嫩绿，有利其繁殖，可用10%大功臣或4.5%高效氯氰菊酯防治。
3、菜青虫 主要取食叶片，造成叶片孔洞或缺刻，严重时吃光叶片，可用50%辛硫磷乳油或2.5%天王星乳油或2.5%功夫乳油3000-4000倍液进行防治。
4、病毒病 又称花叶病，常见病害，严重发生时对产量影响很大，同时使菜籽含油量降低，染病植株抗性降低，易被其他病害侵染。该病主要依靠蚜虫在田间传播蔓延。因此，防治蚜虫是关键。
二、开花期
此期以防治菌核病、霜霉病为主，兼治蚜虫。
1、菌核病 从苗期到成熟都可发生，但以盛花期发病最盛。如盛花期遇高温多雨，加之菌源量大，病害就有流行的可能。在初花期到盛花期用50%多菌灵可湿性粉剂1000倍液喷雾，施药时应注意喷在油菜中、下部茎、叶上，以提高防效。
2、霜霉病 病菌危害油菜花薹，可引起肿胀弯曲成“龙头拐”状，故通称为“龙头病”。初花期当病叶率达10%时，进行第1次防治，隔5-7天再防治1次。常用药剂有50%多菌灵可湿性粉剂，或75%百菌清可湿性粉剂。
3、蚜虫 这一时期，蚜虫危害花序，造成花序生长停滞、畸形，结果减少。可结合防治菌核病、霜霉病复配用药，即在防治菌核病或霜霉病的药液中加入大功臣或蚜虱净进行兼治。
